Protein–RNA interactions for Protein: P28862

Mmp3, Stromelysin-1, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp3P28862 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Mmp3P28862 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mmp3P28862 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mmp3P28862 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mmp3P28862 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mmp3P28862 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Mmp3P28862 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mmp3P28862 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mmp3P28862 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mmp3P28862 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mmp3P28862 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mmp3P28862 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mmp3P28862 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mmp3P28862 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mmp3P28862 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mmp3P28862 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mmp3P28862 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Mmp3P28862 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mmp3P28862 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mmp3P28862 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mmp3P28862 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mmp3P28862 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mmp3P28862 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mmp3P28862 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mmp3P28862 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mmp3P28862 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mmp3P28862 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mmp3P28862 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mmp3P28862 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mmp3P28862 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mmp3P28862 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mmp3P28862 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mmp3P28862 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mmp3P28862 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mmp3P28862 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Mmp3P28862 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mmp3P28862 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mmp3P28862 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mmp3P28862 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mmp3P28862 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mmp3P28862 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mmp3P28862 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mmp3P28862 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mmp3P28862 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mmp3P28862 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mmp3P28862 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mmp3P28862 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mmp3P28862 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mmp3P28862 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mmp3P28862 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mmp3P28862 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mmp3P28862 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mmp3P28862 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mmp3P28862 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Mmp3P28862 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mmp3P28862 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mmp3P28862 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mmp3P28862 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mmp3P28862 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mmp3P28862 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mmp3P28862 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mmp3P28862 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mmp3P28862 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mmp3P28862 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mmp3P28862 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mmp3P28862 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mmp3P28862 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mmp3P28862 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mmp3P28862 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mmp3P28862 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mmp3P28862 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mmp3P28862 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mmp3P28862 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mmp3P28862 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mmp3P28862 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mmp3P28862 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mmp3P28862 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mmp3P28862 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mmp3P28862 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mmp3P28862 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mmp3P28862 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mmp3P28862 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mmp3P28862 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mmp3P28862 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mmp3P28862 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mmp3P28862 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mmp3P28862 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Mmp3P28862 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mmp3P28862 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mmp3P28862 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mmp3P28862 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mmp3P28862 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mmp3P28862 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mmp3P28862 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mmp3P28862 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mmp3P28862 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mmp3P28862 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mmp3P28862 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mmp3P28862 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mmp3P28862 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms