Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxd10P28359 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxd10P28359 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxd10P28359 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxd10P28359 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxd10P28359 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxd10P28359 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxd10P28359 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxd10P28359 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxd10P28359 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxd10P28359 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxd10P28359 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxd10P28359 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxd10P28359 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxd10P28359 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxd10P28359 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxd10P28359 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxd10P28359 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxd10P28359 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxd10P28359 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxd10P28359 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxd10P28359 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxd10P28359 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxd10P28359 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxd10P28359 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxd10P28359 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxd10P28359 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxd10P28359 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxd10P28359 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxd10P28359 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxd10P28359 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxd10P28359 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxd10P28359 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxd10P28359 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxd10P28359 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxd10P28359 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxd10P28359 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxd10P28359 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxd10P28359 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxd10P28359 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxd10P28359 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxd10P28359 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxd10P28359 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxd10P28359 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxd10P28359 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxd10P28359 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxd10P28359 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxd10P28359 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxd10P28359 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxd10P28359 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxd10P28359 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxd10P28359 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxd10P28359 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxd10P28359 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxd10P28359 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxd10P28359 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxd10P28359 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxd10P28359 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxd10P28359 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxd10P28359 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxd10P28359 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxd10P28359 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxd10P28359 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxd10P28359 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxd10P28359 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxd10P28359 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxd10P28359 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxd10P28359 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxd10P28359 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxd10P28359 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxd10P28359 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxd10P28359 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxd10P28359 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxd10P28359 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxd10P28359 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxd10P28359 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxd10P28359 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxd10P28359 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxd10P28359 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxd10P28359 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxd10P28359 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxd10P28359 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxd10P28359 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxd10P28359 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxd10P28359 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hoxd10P28359 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Hoxd10P28359 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Hoxd10P28359 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hoxd10P28359 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hoxd10P28359 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hoxd10P28359 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hoxd10P28359 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxd10P28359 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxd10P28359 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxd10P28359 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxd10P28359 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxd10P28359 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxd10P28359 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxd10P28359 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxd10P28359 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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