Protein–RNA interactions for Protein: P28271

Aco1, Cytoplasmic aconitate hydratase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aco1P28271 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Aco1P28271 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Aco1P28271 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Aco1P28271 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Aco1P28271 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Aco1P28271 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Aco1P28271 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Aco1P28271 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Aco1P28271 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Aco1P28271 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Aco1P28271 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Aco1P28271 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Aco1P28271 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Aco1P28271 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Aco1P28271 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Aco1P28271 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Aco1P28271 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Aco1P28271 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Aco1P28271 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Aco1P28271 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Aco1P28271 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Aco1P28271 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Aco1P28271 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Aco1P28271 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Aco1P28271 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Aco1P28271 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Aco1P28271 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Aco1P28271 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Aco1P28271 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Aco1P28271 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Aco1P28271 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Aco1P28271 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Aco1P28271 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Aco1P28271 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Aco1P28271 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Aco1P28271 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Aco1P28271 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Aco1P28271 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Aco1P28271 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Aco1P28271 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Aco1P28271 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Aco1P28271 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Aco1P28271 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Aco1P28271 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Aco1P28271 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Aco1P28271 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Aco1P28271 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Aco1P28271 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Aco1P28271 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Aco1P28271 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Aco1P28271 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Aco1P28271 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Aco1P28271 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Aco1P28271 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Aco1P28271 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Aco1P28271 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Aco1P28271 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Aco1P28271 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Aco1P28271 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Aco1P28271 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Aco1P28271 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Aco1P28271 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Aco1P28271 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Aco1P28271 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Aco1P28271 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Aco1P28271 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Aco1P28271 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Aco1P28271 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Aco1P28271 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Aco1P28271 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Aco1P28271 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Aco1P28271 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Aco1P28271 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Aco1P28271 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Aco1P28271 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Aco1P28271 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Aco1P28271 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Aco1P28271 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Aco1P28271 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Aco1P28271 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Aco1P28271 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Aco1P28271 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Aco1P28271 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Aco1P28271 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Aco1P28271 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Aco1P28271 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Aco1P28271 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Aco1P28271 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Aco1P28271 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Aco1P28271 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Aco1P28271 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Aco1P28271 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Aco1P28271 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Aco1P28271 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Aco1P28271 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Aco1P28271 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Aco1P28271 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Aco1P28271 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Aco1P28271 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Aco1P28271 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms