Protein–RNA interactions for Protein: P25322

Ccnd1, G1/S-specific cyclin-D1, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd1P25322 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccnd1P25322 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccnd1P25322 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccnd1P25322 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccnd1P25322 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccnd1P25322 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccnd1P25322 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccnd1P25322 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccnd1P25322 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccnd1P25322 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccnd1P25322 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccnd1P25322 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccnd1P25322 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccnd1P25322 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccnd1P25322 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccnd1P25322 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccnd1P25322 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccnd1P25322 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccnd1P25322 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccnd1P25322 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccnd1P25322 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccnd1P25322 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccnd1P25322 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccnd1P25322 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccnd1P25322 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccnd1P25322 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccnd1P25322 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccnd1P25322 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccnd1P25322 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccnd1P25322 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccnd1P25322 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccnd1P25322 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccnd1P25322 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccnd1P25322 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccnd1P25322 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccnd1P25322 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccnd1P25322 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccnd1P25322 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccnd1P25322 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccnd1P25322 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccnd1P25322 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccnd1P25322 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccnd1P25322 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccnd1P25322 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccnd1P25322 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccnd1P25322 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccnd1P25322 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccnd1P25322 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccnd1P25322 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccnd1P25322 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccnd1P25322 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccnd1P25322 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccnd1P25322 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccnd1P25322 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccnd1P25322 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccnd1P25322 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccnd1P25322 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccnd1P25322 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccnd1P25322 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccnd1P25322 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccnd1P25322 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccnd1P25322 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccnd1P25322 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccnd1P25322 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccnd1P25322 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccnd1P25322 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccnd1P25322 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccnd1P25322 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccnd1P25322 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccnd1P25322 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccnd1P25322 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccnd1P25322 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccnd1P25322 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccnd1P25322 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccnd1P25322 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccnd1P25322 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccnd1P25322 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccnd1P25322 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccnd1P25322 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccnd1P25322 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccnd1P25322 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccnd1P25322 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccnd1P25322 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ccnd1P25322 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccnd1P25322 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccnd1P25322 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccnd1P25322 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccnd1P25322 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccnd1P25322 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccnd1P25322 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccnd1P25322 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccnd1P25322 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccnd1P25322 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccnd1P25322 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccnd1P25322 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccnd1P25322 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccnd1P25322 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccnd1P25322 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccnd1P25322 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccnd1P25322 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms