Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NdnP25233 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NdnP25233 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NdnP25233 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NdnP25233 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NdnP25233 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NdnP25233 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NdnP25233 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NdnP25233 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NdnP25233 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NdnP25233 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NdnP25233 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NdnP25233 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NdnP25233 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NdnP25233 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NdnP25233 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NdnP25233 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NdnP25233 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NdnP25233 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NdnP25233 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NdnP25233 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NdnP25233 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NdnP25233 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NdnP25233 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NdnP25233 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NdnP25233 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NdnP25233 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NdnP25233 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NdnP25233 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NdnP25233 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NdnP25233 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NdnP25233 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NdnP25233 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NdnP25233 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NdnP25233 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NdnP25233 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NdnP25233 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NdnP25233 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NdnP25233 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NdnP25233 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NdnP25233 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NdnP25233 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NdnP25233 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NdnP25233 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NdnP25233 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NdnP25233 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NdnP25233 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NdnP25233 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NdnP25233 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NdnP25233 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NdnP25233 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NdnP25233 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NdnP25233 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NdnP25233 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NdnP25233 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NdnP25233 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NdnP25233 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NdnP25233 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NdnP25233 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NdnP25233 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NdnP25233 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NdnP25233 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NdnP25233 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NdnP25233 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NdnP25233 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NdnP25233 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NdnP25233 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NdnP25233 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NdnP25233 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NdnP25233 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NdnP25233 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NdnP25233 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NdnP25233 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NdnP25233 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NdnP25233 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NdnP25233 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NdnP25233 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NdnP25233 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NdnP25233 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NdnP25233 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NdnP25233 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NdnP25233 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NdnP25233 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NdnP25233 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NdnP25233 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NdnP25233 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NdnP25233 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NdnP25233 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NdnP25233 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NdnP25233 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NdnP25233 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NdnP25233 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NdnP25233 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NdnP25233 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NdnP25233 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NdnP25233 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NdnP25233 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NdnP25233 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NdnP25233 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NdnP25233 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms