Protein–RNA interactions for Protein: P25119

Tnfrsf1b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf1bP25119 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfrsf1bP25119 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfrsf1bP25119 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfrsf1bP25119 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfrsf1bP25119 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfrsf1bP25119 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfrsf1bP25119 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfrsf1bP25119 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfrsf1bP25119 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfrsf1bP25119 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfrsf1bP25119 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfrsf1bP25119 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfrsf1bP25119 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfrsf1bP25119 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfrsf1bP25119 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tnfrsf1bP25119 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tnfrsf1bP25119 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tnfrsf1bP25119 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tnfrsf1bP25119 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfrsf1bP25119 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfrsf1bP25119 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfrsf1bP25119 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfrsf1bP25119 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfrsf1bP25119 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfrsf1bP25119 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfrsf1bP25119 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfrsf1bP25119 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfrsf1bP25119 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfrsf1bP25119 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfrsf1bP25119 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfrsf1bP25119 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfrsf1bP25119 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfrsf1bP25119 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfrsf1bP25119 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfrsf1bP25119 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfrsf1bP25119 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfrsf1bP25119 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfrsf1bP25119 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfrsf1bP25119 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfrsf1bP25119 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfrsf1bP25119 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfrsf1bP25119 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfrsf1bP25119 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfrsf1bP25119 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfrsf1bP25119 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfrsf1bP25119 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfrsf1bP25119 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfrsf1bP25119 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfrsf1bP25119 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfrsf1bP25119 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfrsf1bP25119 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfrsf1bP25119 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfrsf1bP25119 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfrsf1bP25119 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfrsf1bP25119 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfrsf1bP25119 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfrsf1bP25119 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfrsf1bP25119 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfrsf1bP25119 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfrsf1bP25119 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfrsf1bP25119 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfrsf1bP25119 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfrsf1bP25119 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfrsf1bP25119 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfrsf1bP25119 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfrsf1bP25119 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfrsf1bP25119 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfrsf1bP25119 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfrsf1bP25119 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfrsf1bP25119 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfrsf1bP25119 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfrsf1bP25119 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfrsf1bP25119 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfrsf1bP25119 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfrsf1bP25119 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfrsf1bP25119 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfrsf1bP25119 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfrsf1bP25119 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfrsf1bP25119 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfrsf1bP25119 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfrsf1bP25119 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfrsf1bP25119 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfrsf1bP25119 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfrsf1bP25119 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfrsf1bP25119 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfrsf1bP25119 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfrsf1bP25119 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfrsf1bP25119 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfrsf1bP25119 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfrsf1bP25119 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfrsf1bP25119 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfrsf1bP25119 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfrsf1bP25119 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfrsf1bP25119 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfrsf1bP25119 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnfrsf1bP25119 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Tnfrsf1bP25119 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfrsf1bP25119 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfrsf1bP25119 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfrsf1bP25119 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms