Protein–RNA interactions for Protein: P24788

Cdk11b, Cyclin-dependent kinase 11B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk11bP24788 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Cdk11bP24788 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Cdk11bP24788 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Cdk11bP24788 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Cdk11bP24788 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Cdk11bP24788 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Cdk11bP24788 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Cdk11bP24788 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Cdk11bP24788 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
Cdk11bP24788 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Cdk11bP24788 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Cdk11bP24788 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Cdk11bP24788 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Cdk11bP24788 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Cdk11bP24788 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Cdk11bP24788 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Cdk11bP24788 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Cdk11bP24788 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Cdk11bP24788 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Cdk11bP24788 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Cdk11bP24788 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Cdk11bP24788 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Cdk11bP24788 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Cdk11bP24788 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Cdk11bP24788 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Cdk11bP24788 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Cdk11bP24788 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Cdk11bP24788 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Cdk11bP24788 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Cdk11bP24788 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Cdk11bP24788 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Cdk11bP24788 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Cdk11bP24788 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Cdk11bP24788 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
Cdk11bP24788 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Cdk11bP24788 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Cdk11bP24788 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Cdk11bP24788 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Cdk11bP24788 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Cdk11bP24788 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Cdk11bP24788 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Cdk11bP24788 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Cdk11bP24788 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Cdk11bP24788 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Cdk11bP24788 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Cdk11bP24788 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Cdk11bP24788 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Cdk11bP24788 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Cdk11bP24788 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Cdk11bP24788 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Cdk11bP24788 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Cdk11bP24788 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Cdk11bP24788 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Cdk11bP24788 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Cdk11bP24788 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Cdk11bP24788 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Cdk11bP24788 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Cdk11bP24788 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Cdk11bP24788 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Cdk11bP24788 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Cdk11bP24788 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Cdk11bP24788 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Cdk11bP24788 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Cdk11bP24788 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Cdk11bP24788 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Cdk11bP24788 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
Cdk11bP24788 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Cdk11bP24788 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Cdk11bP24788 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Cdk11bP24788 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Cdk11bP24788 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Cdk11bP24788 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Cdk11bP24788 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Cdk11bP24788 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Cdk11bP24788 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Cdk11bP24788 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Cdk11bP24788 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Cdk11bP24788 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Cdk11bP24788 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Cdk11bP24788 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Cdk11bP24788 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Cdk11bP24788 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Cdk11bP24788 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Cdk11bP24788 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Cdk11bP24788 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Cdk11bP24788 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Cdk11bP24788 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Cdk11bP24788 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Cdk11bP24788 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Cdk11bP24788 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Cdk11bP24788 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Cdk11bP24788 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Cdk11bP24788 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Cdk11bP24788 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Cdk11bP24788 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Cdk11bP24788 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Cdk11bP24788 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Cdk11bP24788 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Cdk11bP24788 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Cdk11bP24788 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms