Protein–RNA interactions for Protein: P23906

Irf2, Interferon regulatory factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf2P23906 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Irf2P23906 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Irf2P23906 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Irf2P23906 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Irf2P23906 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Irf2P23906 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Irf2P23906 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Irf2P23906 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Irf2P23906 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Irf2P23906 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Irf2P23906 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Irf2P23906 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Irf2P23906 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Irf2P23906 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Irf2P23906 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Irf2P23906 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Irf2P23906 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Irf2P23906 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Irf2P23906 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Irf2P23906 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Irf2P23906 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Irf2P23906 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Irf2P23906 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Irf2P23906 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Irf2P23906 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Irf2P23906 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Irf2P23906 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Irf2P23906 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Irf2P23906 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Irf2P23906 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Irf2P23906 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Irf2P23906 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Irf2P23906 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Irf2P23906 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Irf2P23906 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Irf2P23906 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Irf2P23906 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Irf2P23906 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Irf2P23906 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Irf2P23906 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Irf2P23906 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Irf2P23906 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Irf2P23906 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Irf2P23906 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Irf2P23906 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Irf2P23906 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Irf2P23906 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Irf2P23906 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Irf2P23906 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Irf2P23906 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Irf2P23906 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Irf2P23906 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Irf2P23906 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Irf2P23906 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Irf2P23906 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Irf2P23906 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Irf2P23906 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Irf2P23906 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Irf2P23906 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Irf2P23906 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Irf2P23906 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Irf2P23906 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Irf2P23906 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Irf2P23906 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Irf2P23906 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Irf2P23906 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Irf2P23906 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Irf2P23906 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Irf2P23906 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Irf2P23906 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Irf2P23906 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Irf2P23906 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Irf2P23906 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Irf2P23906 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Irf2P23906 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Irf2P23906 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Irf2P23906 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Irf2P23906 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Irf2P23906 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Irf2P23906 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Irf2P23906 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Irf2P23906 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Irf2P23906 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Irf2P23906 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Irf2P23906 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Irf2P23906 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Irf2P23906 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Irf2P23906 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Irf2P23906 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Irf2P23906 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Irf2P23906 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Irf2P23906 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Irf2P23906 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irf2P23906 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irf2P23906 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irf2P23906 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irf2P23906 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irf2P23906 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irf2P23906 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irf2P23906 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms