Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ms4a2P20490 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ms4a2P20490 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ms4a2P20490 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ms4a2P20490 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ms4a2P20490 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ms4a2P20490 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ms4a2P20490 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ms4a2P20490 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ms4a2P20490 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ms4a2P20490 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ms4a2P20490 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ms4a2P20490 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ms4a2P20490 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ms4a2P20490 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ms4a2P20490 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ms4a2P20490 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ms4a2P20490 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ms4a2P20490 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ms4a2P20490 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ms4a2P20490 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ms4a2P20490 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ms4a2P20490 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ms4a2P20490 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ms4a2P20490 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ms4a2P20490 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ms4a2P20490 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ms4a2P20490 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ms4a2P20490 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ms4a2P20490 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ms4a2P20490 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ms4a2P20490 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ms4a2P20490 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ms4a2P20490 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ms4a2P20490 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ms4a2P20490 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ms4a2P20490 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ms4a2P20490 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ms4a2P20490 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ms4a2P20490 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ms4a2P20490 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ms4a2P20490 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ms4a2P20490 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ms4a2P20490 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ms4a2P20490 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ms4a2P20490 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ms4a2P20490 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ms4a2P20490 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ms4a2P20490 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ms4a2P20490 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ms4a2P20490 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ms4a2P20490 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ms4a2P20490 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ms4a2P20490 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ms4a2P20490 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ms4a2P20490 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ms4a2P20490 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ms4a2P20490 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ms4a2P20490 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ms4a2P20490 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ms4a2P20490 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ms4a2P20490 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ms4a2P20490 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ms4a2P20490 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ms4a2P20490 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ms4a2P20490 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ms4a2P20490 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ms4a2P20490 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ms4a2P20490 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ms4a2P20490 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ms4a2P20490 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ms4a2P20490 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ms4a2P20490 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ms4a2P20490 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ms4a2P20490 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ms4a2P20490 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ms4a2P20490 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ms4a2P20490 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ms4a2P20490 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ms4a2P20490 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ms4a2P20490 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ms4a2P20490 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ms4a2P20490 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ms4a2P20490 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ms4a2P20490 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ms4a2P20490 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ms4a2P20490 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ms4a2P20490 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ms4a2P20490 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ms4a2P20490 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ms4a2P20490 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ms4a2P20490 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ms4a2P20490 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ms4a2P20490 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ms4a2P20490 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ms4a2P20490 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ms4a2P20490 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ms4a2P20490 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ms4a2P20490 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ms4a2P20490 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms