Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrkcaP20444 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrkcaP20444 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrkcaP20444 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrkcaP20444 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrkcaP20444 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrkcaP20444 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrkcaP20444 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrkcaP20444 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrkcaP20444 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrkcaP20444 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrkcaP20444 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrkcaP20444 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrkcaP20444 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrkcaP20444 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrkcaP20444 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrkcaP20444 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrkcaP20444 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrkcaP20444 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrkcaP20444 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrkcaP20444 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrkcaP20444 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrkcaP20444 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrkcaP20444 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrkcaP20444 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrkcaP20444 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrkcaP20444 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PrkcaP20444 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PrkcaP20444 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrkcaP20444 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrkcaP20444 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PrkcaP20444 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PrkcaP20444 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PrkcaP20444 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PrkcaP20444 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PrkcaP20444 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PrkcaP20444 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PrkcaP20444 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PrkcaP20444 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PrkcaP20444 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PrkcaP20444 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PrkcaP20444 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PrkcaP20444 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PrkcaP20444 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PrkcaP20444 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PrkcaP20444 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PrkcaP20444 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PrkcaP20444 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PrkcaP20444 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PrkcaP20444 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PrkcaP20444 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PrkcaP20444 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PrkcaP20444 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PrkcaP20444 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PrkcaP20444 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PrkcaP20444 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PrkcaP20444 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PrkcaP20444 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PrkcaP20444 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PrkcaP20444 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PrkcaP20444 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PrkcaP20444 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PrkcaP20444 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PrkcaP20444 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PrkcaP20444 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PrkcaP20444 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PrkcaP20444 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PrkcaP20444 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PrkcaP20444 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PrkcaP20444 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PrkcaP20444 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PrkcaP20444 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PrkcaP20444 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PrkcaP20444 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PrkcaP20444 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PrkcaP20444 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PrkcaP20444 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PrkcaP20444 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PrkcaP20444 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PrkcaP20444 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PrkcaP20444 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PrkcaP20444 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PrkcaP20444 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PrkcaP20444 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PrkcaP20444 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PrkcaP20444 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrkcaP20444 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrkcaP20444 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrkcaP20444 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrkcaP20444 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrkcaP20444 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrkcaP20444 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrkcaP20444 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrkcaP20444 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrkcaP20444 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrkcaP20444 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrkcaP20444 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrkcaP20444 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PrkcaP20444 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PrkcaP20444 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms