Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ntf3P20181 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ntf3P20181 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ntf3P20181 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ntf3P20181 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ntf3P20181 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ntf3P20181 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ntf3P20181 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ntf3P20181 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ntf3P20181 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ntf3P20181 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ntf3P20181 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ntf3P20181 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ntf3P20181 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ntf3P20181 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ntf3P20181 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ntf3P20181 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ntf3P20181 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ntf3P20181 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ntf3P20181 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ntf3P20181 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ntf3P20181 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ntf3P20181 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ntf3P20181 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ntf3P20181 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ntf3P20181 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ntf3P20181 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ntf3P20181 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ntf3P20181 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ntf3P20181 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ntf3P20181 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ntf3P20181 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ntf3P20181 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ntf3P20181 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ntf3P20181 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ntf3P20181 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ntf3P20181 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ntf3P20181 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ntf3P20181 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ntf3P20181 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ntf3P20181 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ntf3P20181 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ntf3P20181 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ntf3P20181 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ntf3P20181 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ntf3P20181 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ntf3P20181 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ntf3P20181 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ntf3P20181 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ntf3P20181 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ntf3P20181 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ntf3P20181 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ntf3P20181 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ntf3P20181 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ntf3P20181 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ntf3P20181 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ntf3P20181 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ntf3P20181 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ntf3P20181 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ntf3P20181 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ntf3P20181 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ntf3P20181 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ntf3P20181 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ntf3P20181 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ntf3P20181 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ntf3P20181 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ntf3P20181 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ntf3P20181 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ntf3P20181 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ntf3P20181 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ntf3P20181 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ntf3P20181 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ntf3P20181 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ntf3P20181 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ntf3P20181 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ntf3P20181 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ntf3P20181 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ntf3P20181 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ntf3P20181 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ntf3P20181 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ntf3P20181 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ntf3P20181 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ntf3P20181 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ntf3P20181 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ntf3P20181 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ntf3P20181 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ntf3P20181 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ntf3P20181 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ntf3P20181 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ntf3P20181 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ntf3P20181 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ntf3P20181 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ntf3P20181 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ntf3P20181 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ntf3P20181 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ntf3P20181 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ntf3P20181 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ntf3P20181 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ntf3P20181 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ntf3P20181 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms