Protein–RNA interactions for Protein: P19228

Csn1s1, Alpha-S1-casein, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn1s1P19228 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csn1s1P19228 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csn1s1P19228 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csn1s1P19228 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csn1s1P19228 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csn1s1P19228 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csn1s1P19228 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Csn1s1P19228 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Csn1s1P19228 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Csn1s1P19228 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Csn1s1P19228 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Csn1s1P19228 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Csn1s1P19228 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Csn1s1P19228 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Csn1s1P19228 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Csn1s1P19228 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Csn1s1P19228 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Csn1s1P19228 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Csn1s1P19228 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Csn1s1P19228 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Csn1s1P19228 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Csn1s1P19228 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Csn1s1P19228 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Csn1s1P19228 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Csn1s1P19228 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Csn1s1P19228 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Csn1s1P19228 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Csn1s1P19228 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Csn1s1P19228 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Csn1s1P19228 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Csn1s1P19228 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Csn1s1P19228 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Csn1s1P19228 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Csn1s1P19228 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Csn1s1P19228 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Csn1s1P19228 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Csn1s1P19228 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Csn1s1P19228 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Csn1s1P19228 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Csn1s1P19228 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Csn1s1P19228 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Csn1s1P19228 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Csn1s1P19228 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Csn1s1P19228 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Csn1s1P19228 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Csn1s1P19228 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Csn1s1P19228 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Csn1s1P19228 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Csn1s1P19228 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Csn1s1P19228 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Csn1s1P19228 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Csn1s1P19228 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Csn1s1P19228 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Csn1s1P19228 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Csn1s1P19228 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Csn1s1P19228 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Csn1s1P19228 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Csn1s1P19228 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Csn1s1P19228 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Csn1s1P19228 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Csn1s1P19228 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Csn1s1P19228 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Csn1s1P19228 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Csn1s1P19228 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Csn1s1P19228 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Csn1s1P19228 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Csn1s1P19228 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Csn1s1P19228 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Csn1s1P19228 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Csn1s1P19228 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Csn1s1P19228 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Csn1s1P19228 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Csn1s1P19228 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Csn1s1P19228 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Csn1s1P19228 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Csn1s1P19228 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Csn1s1P19228 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Csn1s1P19228 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Csn1s1P19228 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Csn1s1P19228 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Csn1s1P19228 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Csn1s1P19228 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Csn1s1P19228 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Csn1s1P19228 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Csn1s1P19228 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Csn1s1P19228 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Csn1s1P19228 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Csn1s1P19228 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Csn1s1P19228 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Csn1s1P19228 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Csn1s1P19228 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Csn1s1P19228 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Csn1s1P19228 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Csn1s1P19228 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Csn1s1P19228 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Csn1s1P19228 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Csn1s1P19228 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Csn1s1P19228 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Csn1s1P19228 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Csn1s1P19228 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms