Protein–RNA interactions for Protein: P18532

Ig heavy chain V region 1B43, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18532 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
P18532 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P18532 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P18532 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P18532 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P18532 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P18532 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P18532 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P18532 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
P18532 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
P18532 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P18532 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
P18532 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
P18532 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P18532 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
P18532 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
P18532 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
P18532 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
P18532 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
P18532 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
P18532 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
P18532 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
P18532 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
P18532 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
P18532 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
P18532 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
P18532 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
P18532 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
P18532 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
P18532 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P18532 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P18532 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
P18532 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
P18532 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P18532 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
P18532 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P18532 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
P18532 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P18532 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P18532 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
P18532 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
P18532 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P18532 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P18532 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P18532 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P18532 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P18532 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
P18532 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
P18532 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P18532 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P18532 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
P18532 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
P18532 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
P18532 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
P18532 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
P18532 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
P18532 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
P18532 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
P18532 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
P18532 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
P18532 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
P18532 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
P18532 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P18532 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P18532 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
P18532 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
P18532 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P18532 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
P18532 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
P18532 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P18532 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P18532 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P18532 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
P18532 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P18532 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P18532 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
P18532 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P18532 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
P18532 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P18532 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P18532 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
P18532 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
P18532 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
P18532 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
P18532 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
P18532 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
P18532 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
P18532 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
P18532 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
P18532 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
P18532 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
P18532 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
P18532 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
P18532 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
P18532 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
P18532 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
P18532 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
P18532 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
P18532 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
P18532 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms