Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P18530 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P18530 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P18530 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P18530 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P18530 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P18530 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P18530 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P18530 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P18530 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P18530 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
P18530 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P18530 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P18530 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
P18530 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P18530 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P18530 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
P18530 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P18530 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P18530 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P18530 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P18530 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P18530 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P18530 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P18530 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P18530 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P18530 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P18530 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P18530 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P18530 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P18530 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P18530 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P18530 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P18530 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P18530 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P18530 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P18530 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P18530 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P18530 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P18530 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P18530 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P18530 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P18530 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P18530 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P18530 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P18530 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P18530 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P18530 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P18530 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P18530 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P18530 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P18530 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P18530 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P18530 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P18530 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P18530 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P18530 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P18530 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P18530 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P18530 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P18530 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P18530 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P18530 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P18530 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
P18530 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
P18530 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P18530 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P18530 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P18530 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P18530 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P18530 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P18530 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P18530 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
P18530 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P18530 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
P18530 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P18530 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P18530 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P18530 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P18530 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P18530 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P18530 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P18530 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P18530 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P18530 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P18530 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P18530 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P18530 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P18530 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P18530 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P18530 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P18530 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P18530 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P18530 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P18530 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P18530 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P18530 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P18530 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P18530 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
P18530 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms