Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

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Length 98 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P18528 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
P18528 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
P18528 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P18528 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P18528 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P18528 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P18528 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P18528 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
P18528 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
P18528 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P18528 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
P18528 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P18528 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P18528 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P18528 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P18528 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P18528 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P18528 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P18528 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P18528 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P18528 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P18528 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P18528 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P18528 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P18528 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P18528 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P18528 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P18528 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P18528 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P18528 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P18528 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P18528 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P18528 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P18528 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P18528 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P18528 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P18528 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P18528 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P18528 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P18528 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P18528 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P18528 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P18528 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P18528 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P18528 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P18528 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P18528 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P18528 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P18528 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P18528 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P18528 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P18528 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P18528 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P18528 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P18528 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P18528 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P18528 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P18528 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P18528 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P18528 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P18528 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P18528 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P18528 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P18528 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P18528 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P18528 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P18528 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P18528 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P18528 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P18528 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P18528 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
P18528 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P18528 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P18528 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P18528 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P18528 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P18528 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P18528 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P18528 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P18528 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P18528 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P18528 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P18528 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P18528 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P18528 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P18528 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P18528 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P18528 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P18528 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P18528 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P18528 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P18528 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P18528 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P18528 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P18528 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P18528 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18528 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
P18528 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P18528 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms