Protein–RNA interactions for Protein: P18527

Ig heavy chain V region 914, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18527 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P18527 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P18527 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P18527 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P18527 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P18527 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P18527 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
P18527 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P18527 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P18527 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P18527 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P18527 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
P18527 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P18527 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P18527 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
P18527 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P18527 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P18527 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P18527 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
P18527 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
P18527 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P18527 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
P18527 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P18527 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P18527 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
P18527 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
P18527 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
P18527 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
P18527 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
P18527 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P18527 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
P18527 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P18527 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P18527 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
P18527 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P18527 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
P18527 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P18527 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
P18527 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P18527 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P18527 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
P18527 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P18527 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P18527 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P18527 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P18527 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P18527 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P18527 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
P18527 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P18527 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P18527 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P18527 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
P18527 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P18527 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P18527 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P18527 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
P18527 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P18527 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P18527 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P18527 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P18527 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P18527 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P18527 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P18527 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P18527 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P18527 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
P18527 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
P18527 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
P18527 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
P18527 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P18527 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
P18527 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
P18527 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
P18527 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
P18527 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
P18527 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P18527 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P18527 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P18527 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P18527 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P18527 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
P18527 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
P18527 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
P18527 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
P18527 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
P18527 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P18527 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P18527 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P18527 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P18527 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P18527 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P18527 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
P18527 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
P18527 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P18527 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P18527 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P18527 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P18527 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
P18527 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P18527 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms