Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Defa-rs1P17533 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Defa-rs1P17533 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Defa-rs1P17533 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Defa-rs1P17533 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Defa-rs1P17533 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Defa-rs1P17533 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Defa-rs1P17533 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Defa-rs1P17533 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Defa-rs1P17533 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Defa-rs1P17533 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Defa-rs1P17533 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Defa-rs1P17533 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Defa-rs1P17533 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Defa-rs1P17533 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Defa-rs1P17533 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Defa-rs1P17533 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Defa-rs1P17533 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Defa-rs1P17533 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Defa-rs1P17533 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Defa-rs1P17533 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Defa-rs1P17533 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Defa-rs1P17533 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Defa-rs1P17533 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Defa-rs1P17533 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Defa-rs1P17533 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Defa-rs1P17533 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Defa-rs1P17533 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Defa-rs1P17533 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Defa-rs1P17533 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Defa-rs1P17533 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Defa-rs1P17533 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Defa-rs1P17533 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Defa-rs1P17533 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Defa-rs1P17533 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Defa-rs1P17533 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Defa-rs1P17533 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Defa-rs1P17533 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Defa-rs1P17533 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Defa-rs1P17533 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Defa-rs1P17533 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Defa-rs1P17533 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Defa-rs1P17533 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Defa-rs1P17533 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Defa-rs1P17533 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Defa-rs1P17533 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Defa-rs1P17533 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Defa-rs1P17533 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Defa-rs1P17533 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Defa-rs1P17533 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Defa-rs1P17533 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Defa-rs1P17533 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Defa-rs1P17533 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Defa-rs1P17533 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Defa-rs1P17533 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Defa-rs1P17533 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Defa-rs1P17533 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Defa-rs1P17533 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Defa-rs1P17533 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Defa-rs1P17533 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Defa-rs1P17533 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Defa-rs1P17533 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Defa-rs1P17533 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Defa-rs1P17533 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Defa-rs1P17533 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Defa-rs1P17533 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Defa-rs1P17533 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Defa-rs1P17533 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Defa-rs1P17533 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Defa-rs1P17533 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Defa-rs1P17533 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Defa-rs1P17533 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Defa-rs1P17533 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Defa-rs1P17533 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Defa-rs1P17533 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Defa-rs1P17533 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Defa-rs1P17533 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Defa-rs1P17533 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Defa-rs1P17533 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Defa-rs1P17533 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Defa-rs1P17533 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Defa-rs1P17533 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Defa-rs1P17533 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Defa-rs1P17533 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Defa-rs1P17533 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Defa-rs1P17533 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Defa-rs1P17533 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Defa-rs1P17533 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Defa-rs1P17533 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Defa-rs1P17533 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Defa-rs1P17533 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Defa-rs1P17533 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Defa-rs1P17533 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Defa-rs1P17533 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Defa-rs1P17533 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Defa-rs1P17533 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Defa-rs1P17533 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Defa-rs1P17533 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Defa-rs1P17533 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Defa-rs1P17533 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms