Protein–RNA interactions for Protein: P16092

Fgfr1, Fibroblast growth factor receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgfr1P16092 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fgfr1P16092 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Fgfr1P16092 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fgfr1P16092 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fgfr1P16092 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fgfr1P16092 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fgfr1P16092 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fgfr1P16092 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fgfr1P16092 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fgfr1P16092 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fgfr1P16092 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fgfr1P16092 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fgfr1P16092 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fgfr1P16092 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fgfr1P16092 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fgfr1P16092 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fgfr1P16092 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fgfr1P16092 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fgfr1P16092 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fgfr1P16092 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fgfr1P16092 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fgfr1P16092 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fgfr1P16092 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fgfr1P16092 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fgfr1P16092 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fgfr1P16092 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fgfr1P16092 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fgfr1P16092 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fgfr1P16092 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fgfr1P16092 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fgfr1P16092 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fgfr1P16092 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fgfr1P16092 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fgfr1P16092 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fgfr1P16092 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fgfr1P16092 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fgfr1P16092 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fgfr1P16092 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fgfr1P16092 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fgfr1P16092 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fgfr1P16092 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fgfr1P16092 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Fgfr1P16092 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fgfr1P16092 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fgfr1P16092 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fgfr1P16092 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fgfr1P16092 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fgfr1P16092 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fgfr1P16092 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fgfr1P16092 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Fgfr1P16092 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fgfr1P16092 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Fgfr1P16092 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fgfr1P16092 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Fgfr1P16092 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Fgfr1P16092 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Fgfr1P16092 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fgfr1P16092 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fgfr1P16092 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fgfr1P16092 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fgfr1P16092 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fgfr1P16092 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fgfr1P16092 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fgfr1P16092 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fgfr1P16092 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Fgfr1P16092 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fgfr1P16092 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fgfr1P16092 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fgfr1P16092 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fgfr1P16092 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fgfr1P16092 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Fgfr1P16092 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fgfr1P16092 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fgfr1P16092 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fgfr1P16092 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fgfr1P16092 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fgfr1P16092 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fgfr1P16092 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fgfr1P16092 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fgfr1P16092 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Fgfr1P16092 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fgfr1P16092 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fgfr1P16092 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fgfr1P16092 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fgfr1P16092 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Fgfr1P16092 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fgfr1P16092 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fgfr1P16092 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fgfr1P16092 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fgfr1P16092 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fgfr1P16092 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fgfr1P16092 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fgfr1P16092 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fgfr1P16092 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fgfr1P16092 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fgfr1P16092 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fgfr1P16092 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fgfr1P16092 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Fgfr1P16092 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fgfr1P16092 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms