Protein–RNA interactions for Protein: P16054

Prkce, Protein kinase C epsilon type, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkceP16054 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PrkceP16054 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PrkceP16054 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PrkceP16054 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PrkceP16054 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PrkceP16054 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PrkceP16054 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PrkceP16054 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PrkceP16054 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PrkceP16054 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PrkceP16054 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PrkceP16054 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PrkceP16054 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PrkceP16054 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PrkceP16054 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PrkceP16054 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PrkceP16054 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PrkceP16054 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PrkceP16054 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PrkceP16054 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PrkceP16054 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PrkceP16054 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PrkceP16054 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PrkceP16054 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PrkceP16054 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PrkceP16054 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PrkceP16054 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PrkceP16054 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PrkceP16054 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PrkceP16054 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PrkceP16054 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PrkceP16054 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PrkceP16054 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PrkceP16054 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PrkceP16054 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PrkceP16054 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PrkceP16054 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PrkceP16054 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PrkceP16054 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PrkceP16054 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PrkceP16054 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PrkceP16054 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PrkceP16054 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PrkceP16054 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PrkceP16054 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PrkceP16054 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PrkceP16054 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PrkceP16054 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PrkceP16054 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PrkceP16054 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PrkceP16054 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PrkceP16054 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PrkceP16054 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PrkceP16054 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PrkceP16054 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PrkceP16054 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PrkceP16054 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PrkceP16054 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PrkceP16054 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PrkceP16054 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PrkceP16054 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PrkceP16054 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PrkceP16054 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PrkceP16054 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PrkceP16054 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PrkceP16054 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PrkceP16054 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PrkceP16054 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PrkceP16054 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PrkceP16054 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PrkceP16054 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PrkceP16054 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PrkceP16054 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PrkceP16054 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PrkceP16054 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PrkceP16054 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PrkceP16054 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PrkceP16054 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PrkceP16054 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PrkceP16054 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PrkceP16054 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PrkceP16054 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PrkceP16054 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PrkceP16054 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PrkceP16054 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PrkceP16054 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PrkceP16054 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PrkceP16054 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PrkceP16054 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PrkceP16054 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PrkceP16054 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PrkceP16054 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PrkceP16054 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PrkceP16054 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PrkceP16054 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PrkceP16054 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PrkceP16054 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PrkceP16054 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PrkceP16054 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PrkceP16054 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms