Protein–RNA interactions for Protein: P15620

Znf271, Zinc finger protein 271, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf271P15620 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf271P15620 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf271P15620 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf271P15620 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf271P15620 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf271P15620 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf271P15620 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf271P15620 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf271P15620 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf271P15620 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf271P15620 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf271P15620 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf271P15620 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf271P15620 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf271P15620 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf271P15620 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf271P15620 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf271P15620 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Znf271P15620 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Znf271P15620 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Znf271P15620 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Znf271P15620 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Znf271P15620 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Znf271P15620 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Znf271P15620 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Znf271P15620 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Znf271P15620 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Znf271P15620 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Znf271P15620 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Znf271P15620 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Znf271P15620 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Znf271P15620 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Znf271P15620 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Znf271P15620 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Znf271P15620 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Znf271P15620 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Znf271P15620 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Znf271P15620 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Znf271P15620 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Znf271P15620 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Znf271P15620 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Znf271P15620 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Znf271P15620 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Znf271P15620 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Znf271P15620 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Znf271P15620 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Znf271P15620 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Znf271P15620 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Znf271P15620 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Znf271P15620 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Znf271P15620 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Znf271P15620 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Znf271P15620 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Znf271P15620 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Znf271P15620 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Znf271P15620 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Znf271P15620 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Znf271P15620 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Znf271P15620 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Znf271P15620 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Znf271P15620 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Znf271P15620 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Znf271P15620 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Znf271P15620 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Znf271P15620 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Znf271P15620 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Znf271P15620 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Znf271P15620 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Znf271P15620 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Znf271P15620 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Znf271P15620 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Znf271P15620 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Znf271P15620 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Znf271P15620 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Znf271P15620 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Znf271P15620 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Znf271P15620 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Znf271P15620 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Znf271P15620 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Znf271P15620 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Znf271P15620 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Znf271P15620 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Znf271P15620 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Znf271P15620 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Znf271P15620 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Znf271P15620 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Znf271P15620 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Znf271P15620 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Znf271P15620 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Znf271P15620 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Znf271P15620 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Znf271P15620 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Znf271P15620 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Znf271P15620 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Znf271P15620 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Znf271P15620 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Znf271P15620 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Znf271P15620 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Znf271P15620 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Znf271P15620 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms