Protein–RNA interactions for Protein: P15532

Nme1, Nucleoside diphosphate kinase A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme1P15532 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nme1P15532 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nme1P15532 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nme1P15532 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nme1P15532 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nme1P15532 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nme1P15532 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nme1P15532 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nme1P15532 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nme1P15532 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nme1P15532 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nme1P15532 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nme1P15532 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nme1P15532 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nme1P15532 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nme1P15532 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nme1P15532 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nme1P15532 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nme1P15532 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nme1P15532 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nme1P15532 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nme1P15532 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nme1P15532 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nme1P15532 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nme1P15532 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nme1P15532 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nme1P15532 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nme1P15532 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nme1P15532 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nme1P15532 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nme1P15532 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nme1P15532 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nme1P15532 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nme1P15532 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nme1P15532 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nme1P15532 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nme1P15532 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nme1P15532 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nme1P15532 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nme1P15532 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nme1P15532 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nme1P15532 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nme1P15532 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nme1P15532 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nme1P15532 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nme1P15532 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nme1P15532 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nme1P15532 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nme1P15532 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nme1P15532 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nme1P15532 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nme1P15532 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nme1P15532 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nme1P15532 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nme1P15532 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nme1P15532 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nme1P15532 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nme1P15532 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nme1P15532 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nme1P15532 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Nme1P15532 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Nme1P15532 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Nme1P15532 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nme1P15532 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Nme1P15532 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nme1P15532 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nme1P15532 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nme1P15532 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nme1P15532 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nme1P15532 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nme1P15532 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nme1P15532 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nme1P15532 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nme1P15532 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nme1P15532 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nme1P15532 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nme1P15532 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nme1P15532 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nme1P15532 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nme1P15532 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nme1P15532 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nme1P15532 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nme1P15532 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nme1P15532 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nme1P15532 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Nme1P15532 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nme1P15532 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Nme1P15532 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nme1P15532 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nme1P15532 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nme1P15532 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nme1P15532 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nme1P15532 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nme1P15532 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nme1P15532 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nme1P15532 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Nme1P15532 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nme1P15532 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nme1P15532 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nme1P15532 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms