Protein–RNA interactions for Protein: P15375

Myf6, Myogenic factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myf6P15375 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Myf6P15375 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Myf6P15375 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Myf6P15375 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Myf6P15375 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Myf6P15375 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Myf6P15375 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Myf6P15375 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Myf6P15375 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Myf6P15375 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Myf6P15375 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Myf6P15375 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Myf6P15375 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Myf6P15375 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Myf6P15375 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Myf6P15375 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Myf6P15375 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Myf6P15375 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Myf6P15375 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Myf6P15375 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Myf6P15375 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Myf6P15375 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Myf6P15375 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Myf6P15375 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Myf6P15375 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Myf6P15375 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Myf6P15375 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Myf6P15375 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Myf6P15375 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Myf6P15375 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Myf6P15375 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Myf6P15375 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Myf6P15375 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Myf6P15375 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Myf6P15375 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Myf6P15375 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Myf6P15375 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Myf6P15375 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Myf6P15375 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Myf6P15375 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Myf6P15375 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Myf6P15375 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Myf6P15375 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Myf6P15375 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Myf6P15375 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Myf6P15375 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Myf6P15375 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Myf6P15375 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Myf6P15375 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Myf6P15375 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Myf6P15375 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Myf6P15375 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Myf6P15375 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Myf6P15375 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Myf6P15375 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Myf6P15375 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Myf6P15375 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Myf6P15375 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Myf6P15375 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Myf6P15375 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Myf6P15375 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Myf6P15375 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Myf6P15375 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Myf6P15375 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Myf6P15375 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Myf6P15375 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Myf6P15375 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Myf6P15375 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Myf6P15375 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Myf6P15375 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Myf6P15375 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Myf6P15375 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Myf6P15375 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Myf6P15375 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Myf6P15375 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Myf6P15375 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Myf6P15375 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Myf6P15375 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Myf6P15375 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Myf6P15375 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Myf6P15375 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Myf6P15375 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Myf6P15375 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Myf6P15375 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Myf6P15375 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Myf6P15375 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Myf6P15375 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Myf6P15375 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Myf6P15375 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Myf6P15375 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Myf6P15375 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Myf6P15375 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Myf6P15375 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Myf6P15375 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Myf6P15375 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Myf6P15375 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Myf6P15375 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Myf6P15375 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Myf6P15375 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Myf6P15375 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77 ms