Protein–RNA interactions for Protein: P12850

Cxcl1, Growth-regulated alpha protein, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl1P12850 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cxcl1P12850 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cxcl1P12850 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cxcl1P12850 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cxcl1P12850 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cxcl1P12850 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cxcl1P12850 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cxcl1P12850 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cxcl1P12850 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cxcl1P12850 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cxcl1P12850 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cxcl1P12850 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cxcl1P12850 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cxcl1P12850 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cxcl1P12850 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cxcl1P12850 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cxcl1P12850 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cxcl1P12850 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cxcl1P12850 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cxcl1P12850 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cxcl1P12850 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cxcl1P12850 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cxcl1P12850 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cxcl1P12850 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cxcl1P12850 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cxcl1P12850 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cxcl1P12850 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cxcl1P12850 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cxcl1P12850 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cxcl1P12850 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cxcl1P12850 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cxcl1P12850 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cxcl1P12850 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cxcl1P12850 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cxcl1P12850 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cxcl1P12850 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cxcl1P12850 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cxcl1P12850 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cxcl1P12850 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cxcl1P12850 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cxcl1P12850 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cxcl1P12850 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cxcl1P12850 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cxcl1P12850 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cxcl1P12850 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cxcl1P12850 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cxcl1P12850 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cxcl1P12850 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cxcl1P12850 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cxcl1P12850 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cxcl1P12850 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cxcl1P12850 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cxcl1P12850 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cxcl1P12850 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cxcl1P12850 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cxcl1P12850 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cxcl1P12850 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cxcl1P12850 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cxcl1P12850 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cxcl1P12850 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cxcl1P12850 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cxcl1P12850 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cxcl1P12850 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cxcl1P12850 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cxcl1P12850 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cxcl1P12850 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cxcl1P12850 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cxcl1P12850 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cxcl1P12850 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxcl1P12850 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxcl1P12850 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxcl1P12850 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxcl1P12850 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxcl1P12850 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxcl1P12850 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxcl1P12850 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxcl1P12850 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxcl1P12850 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxcl1P12850 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxcl1P12850 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxcl1P12850 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxcl1P12850 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxcl1P12850 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxcl1P12850 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cxcl1P12850 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cxcl1P12850 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cxcl1P12850 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cxcl1P12850 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cxcl1P12850 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cxcl1P12850 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cxcl1P12850 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cxcl1P12850 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cxcl1P12850 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cxcl1P12850 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cxcl1P12850 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cxcl1P12850 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cxcl1P12850 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cxcl1P12850 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cxcl1P12850 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cxcl1P12850 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms