Protein–RNA interactions for Protein: P11370

Fv4, Retrovirus-related Env polyprotein from Fv-4 locus, mousemouse

Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fv4P11370 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fv4P11370 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fv4P11370 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fv4P11370 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fv4P11370 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fv4P11370 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fv4P11370 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fv4P11370 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fv4P11370 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fv4P11370 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fv4P11370 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fv4P11370 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fv4P11370 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fv4P11370 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Fv4P11370 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Fv4P11370 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Fv4P11370 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Fv4P11370 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Fv4P11370 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Fv4P11370 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Fv4P11370 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Fv4P11370 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fv4P11370 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fv4P11370 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fv4P11370 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fv4P11370 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fv4P11370 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fv4P11370 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fv4P11370 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fv4P11370 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fv4P11370 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Fv4P11370 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fv4P11370 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fv4P11370 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fv4P11370 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fv4P11370 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fv4P11370 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fv4P11370 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fv4P11370 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fv4P11370 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fv4P11370 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Fv4P11370 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fv4P11370 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fv4P11370 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fv4P11370 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Fv4P11370 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fv4P11370 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fv4P11370 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fv4P11370 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fv4P11370 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fv4P11370 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fv4P11370 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fv4P11370 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fv4P11370 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fv4P11370 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fv4P11370 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fv4P11370 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Fv4P11370 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fv4P11370 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fv4P11370 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fv4P11370 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fv4P11370 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fv4P11370 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fv4P11370 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Fv4P11370 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fv4P11370 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fv4P11370 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fv4P11370 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fv4P11370 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fv4P11370 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fv4P11370 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fv4P11370 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fv4P11370 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fv4P11370 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fv4P11370 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fv4P11370 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fv4P11370 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fv4P11370 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fv4P11370 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fv4P11370 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Fv4P11370 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Fv4P11370 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Fv4P11370 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fv4P11370 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fv4P11370 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Fv4P11370 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fv4P11370 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fv4P11370 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fv4P11370 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fv4P11370 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fv4P11370 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fv4P11370 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fv4P11370 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fv4P11370 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Fv4P11370 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Fv4P11370 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Fv4P11370 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Fv4P11370 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fv4P11370 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fv4P11370 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms