Protein–RNA interactions for Protein: P10287

Cdh3, Cadherin-3, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh3P10287 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdh3P10287 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdh3P10287 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdh3P10287 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdh3P10287 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdh3P10287 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdh3P10287 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdh3P10287 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdh3P10287 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdh3P10287 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdh3P10287 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdh3P10287 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdh3P10287 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdh3P10287 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdh3P10287 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdh3P10287 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdh3P10287 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdh3P10287 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdh3P10287 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdh3P10287 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdh3P10287 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdh3P10287 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdh3P10287 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdh3P10287 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdh3P10287 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdh3P10287 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdh3P10287 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdh3P10287 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdh3P10287 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdh3P10287 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdh3P10287 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdh3P10287 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdh3P10287 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdh3P10287 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdh3P10287 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdh3P10287 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdh3P10287 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdh3P10287 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdh3P10287 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdh3P10287 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdh3P10287 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdh3P10287 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdh3P10287 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdh3P10287 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdh3P10287 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdh3P10287 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdh3P10287 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdh3P10287 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdh3P10287 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdh3P10287 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdh3P10287 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdh3P10287 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdh3P10287 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdh3P10287 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdh3P10287 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdh3P10287 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdh3P10287 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdh3P10287 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdh3P10287 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdh3P10287 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdh3P10287 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdh3P10287 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdh3P10287 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdh3P10287 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdh3P10287 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdh3P10287 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdh3P10287 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdh3P10287 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdh3P10287 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdh3P10287 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdh3P10287 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdh3P10287 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdh3P10287 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cdh3P10287 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Cdh3P10287 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cdh3P10287 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdh3P10287 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdh3P10287 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdh3P10287 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdh3P10287 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdh3P10287 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdh3P10287 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdh3P10287 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdh3P10287 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdh3P10287 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdh3P10287 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdh3P10287 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdh3P10287 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdh3P10287 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdh3P10287 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdh3P10287 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdh3P10287 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdh3P10287 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdh3P10287 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdh3P10287 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdh3P10287 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdh3P10287 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdh3P10287 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdh3P10287 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdh3P10287 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms