Protein–RNA interactions for Protein: P0DPB4

Schip1, Schwannomin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Schip1P0DPB4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Schip1P0DPB4 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Schip1P0DPB4 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Schip1P0DPB4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Schip1P0DPB4 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Schip1P0DPB4 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Schip1P0DPB4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Schip1P0DPB4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Schip1P0DPB4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Schip1P0DPB4 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Schip1P0DPB4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Schip1P0DPB4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Schip1P0DPB4 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Schip1P0DPB4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Schip1P0DPB4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Schip1P0DPB4 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Schip1P0DPB4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Schip1P0DPB4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Schip1P0DPB4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Schip1P0DPB4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Schip1P0DPB4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Schip1P0DPB4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Schip1P0DPB4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Schip1P0DPB4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Schip1P0DPB4 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Schip1P0DPB4 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Schip1P0DPB4 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Schip1P0DPB4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Schip1P0DPB4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Schip1P0DPB4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Schip1P0DPB4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Schip1P0DPB4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Schip1P0DPB4 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Schip1P0DPB4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Schip1P0DPB4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Schip1P0DPB4 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Schip1P0DPB4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Schip1P0DPB4 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Schip1P0DPB4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Schip1P0DPB4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Schip1P0DPB4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Schip1P0DPB4 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Schip1P0DPB4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Schip1P0DPB4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Schip1P0DPB4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Schip1P0DPB4 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Schip1P0DPB4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Schip1P0DPB4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Schip1P0DPB4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Schip1P0DPB4 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Schip1P0DPB4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Schip1P0DPB4 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Schip1P0DPB4 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Schip1P0DPB4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Schip1P0DPB4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Schip1P0DPB4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Schip1P0DPB4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Schip1P0DPB4 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Schip1P0DPB4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Schip1P0DPB4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Schip1P0DPB4 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Schip1P0DPB4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Schip1P0DPB4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Schip1P0DPB4 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Schip1P0DPB4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Schip1P0DPB4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Schip1P0DPB4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Schip1P0DPB4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Schip1P0DPB4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Schip1P0DPB4 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Schip1P0DPB4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Schip1P0DPB4 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Schip1P0DPB4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Schip1P0DPB4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Schip1P0DPB4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Schip1P0DPB4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Schip1P0DPB4 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Schip1P0DPB4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Schip1P0DPB4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Schip1P0DPB4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Schip1P0DPB4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Schip1P0DPB4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Schip1P0DPB4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Schip1P0DPB4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Schip1P0DPB4 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Schip1P0DPB4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Schip1P0DPB4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Schip1P0DPB4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Schip1P0DPB4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Schip1P0DPB4 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Schip1P0DPB4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Schip1P0DPB4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Schip1P0DPB4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Schip1P0DPB4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Schip1P0DPB4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Schip1P0DPB4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Schip1P0DPB4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Schip1P0DPB4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Schip1P0DPB4 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Schip1P0DPB4 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms