Protein–RNA interactions for Protein: P0CW02

Ly6c1, Lymphocyte antigen 6C1, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6c1P0CW02 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ly6c1P0CW02 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ly6c1P0CW02 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ly6c1P0CW02 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ly6c1P0CW02 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ly6c1P0CW02 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ly6c1P0CW02 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ly6c1P0CW02 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ly6c1P0CW02 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ly6c1P0CW02 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ly6c1P0CW02 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ly6c1P0CW02 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ly6c1P0CW02 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ly6c1P0CW02 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ly6c1P0CW02 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ly6c1P0CW02 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ly6c1P0CW02 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ly6c1P0CW02 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ly6c1P0CW02 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ly6c1P0CW02 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ly6c1P0CW02 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ly6c1P0CW02 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ly6c1P0CW02 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ly6c1P0CW02 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ly6c1P0CW02 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ly6c1P0CW02 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ly6c1P0CW02 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ly6c1P0CW02 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ly6c1P0CW02 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ly6c1P0CW02 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ly6c1P0CW02 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ly6c1P0CW02 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ly6c1P0CW02 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ly6c1P0CW02 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ly6c1P0CW02 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ly6c1P0CW02 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ly6c1P0CW02 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ly6c1P0CW02 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ly6c1P0CW02 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ly6c1P0CW02 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ly6c1P0CW02 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ly6c1P0CW02 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ly6c1P0CW02 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ly6c1P0CW02 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ly6c1P0CW02 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ly6c1P0CW02 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ly6c1P0CW02 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ly6c1P0CW02 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ly6c1P0CW02 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ly6c1P0CW02 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ly6c1P0CW02 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ly6c1P0CW02 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ly6c1P0CW02 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ly6c1P0CW02 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ly6c1P0CW02 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ly6c1P0CW02 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ly6c1P0CW02 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ly6c1P0CW02 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ly6c1P0CW02 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ly6c1P0CW02 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ly6c1P0CW02 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ly6c1P0CW02 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ly6c1P0CW02 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ly6c1P0CW02 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ly6c1P0CW02 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ly6c1P0CW02 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ly6c1P0CW02 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ly6c1P0CW02 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ly6c1P0CW02 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ly6c1P0CW02 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ly6c1P0CW02 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ly6c1P0CW02 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ly6c1P0CW02 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ly6c1P0CW02 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ly6c1P0CW02 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ly6c1P0CW02 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ly6c1P0CW02 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ly6c1P0CW02 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ly6c1P0CW02 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ly6c1P0CW02 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ly6c1P0CW02 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ly6c1P0CW02 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ly6c1P0CW02 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ly6c1P0CW02 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ly6c1P0CW02 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ly6c1P0CW02 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ly6c1P0CW02 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ly6c1P0CW02 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ly6c1P0CW02 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ly6c1P0CW02 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ly6c1P0CW02 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ly6c1P0CW02 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ly6c1P0CW02 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ly6c1P0CW02 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ly6c1P0CW02 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ly6c1P0CW02 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ly6c1P0CW02 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ly6c1P0CW02 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ly6c1P0CW02 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ly6c1P0CW02 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms