Protein–RNA interactions for Protein: P0CG49

Ubb, Polyubiquitin-B, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbbP0CG49 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UbbP0CG49 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
UbbP0CG49 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UbbP0CG49 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UbbP0CG49 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UbbP0CG49 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UbbP0CG49 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UbbP0CG49 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UbbP0CG49 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UbbP0CG49 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UbbP0CG49 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UbbP0CG49 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UbbP0CG49 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UbbP0CG49 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UbbP0CG49 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UbbP0CG49 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UbbP0CG49 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UbbP0CG49 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
UbbP0CG49 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
UbbP0CG49 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
UbbP0CG49 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
UbbP0CG49 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
UbbP0CG49 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UbbP0CG49 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UbbP0CG49 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UbbP0CG49 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UbbP0CG49 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
UbbP0CG49 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UbbP0CG49 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UbbP0CG49 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UbbP0CG49 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
UbbP0CG49 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UbbP0CG49 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UbbP0CG49 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UbbP0CG49 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
UbbP0CG49 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
UbbP0CG49 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UbbP0CG49 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UbbP0CG49 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UbbP0CG49 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UbbP0CG49 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UbbP0CG49 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UbbP0CG49 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UbbP0CG49 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UbbP0CG49 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UbbP0CG49 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
UbbP0CG49 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UbbP0CG49 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UbbP0CG49 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UbbP0CG49 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UbbP0CG49 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
UbbP0CG49 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
UbbP0CG49 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
UbbP0CG49 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
UbbP0CG49 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
UbbP0CG49 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
UbbP0CG49 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
UbbP0CG49 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
UbbP0CG49 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
UbbP0CG49 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
UbbP0CG49 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
UbbP0CG49 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
UbbP0CG49 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
UbbP0CG49 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
UbbP0CG49 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
UbbP0CG49 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
UbbP0CG49 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
UbbP0CG49 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
UbbP0CG49 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
UbbP0CG49 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
UbbP0CG49 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
UbbP0CG49 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
UbbP0CG49 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UbbP0CG49 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UbbP0CG49 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UbbP0CG49 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UbbP0CG49 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UbbP0CG49 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UbbP0CG49 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UbbP0CG49 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UbbP0CG49 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UbbP0CG49 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UbbP0CG49 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UbbP0CG49 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UbbP0CG49 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
UbbP0CG49 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
UbbP0CG49 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UbbP0CG49 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UbbP0CG49 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UbbP0CG49 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UbbP0CG49 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UbbP0CG49 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UbbP0CG49 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
UbbP0CG49 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UbbP0CG49 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
UbbP0CG49 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
UbbP0CG49 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
UbbP0CG49 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
UbbP0CG49 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
UbbP0CG49 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms