Protein–RNA interactions for Protein: P0C6B7

Igsf6, Immunoglobulin superfamily member 6, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igsf6P0C6B7 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Igsf6P0C6B7 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Igsf6P0C6B7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Igsf6P0C6B7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Igsf6P0C6B7 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Igsf6P0C6B7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Igsf6P0C6B7 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Igsf6P0C6B7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Igsf6P0C6B7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Igsf6P0C6B7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Igsf6P0C6B7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Igsf6P0C6B7 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Igsf6P0C6B7 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Igsf6P0C6B7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Igsf6P0C6B7 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Igsf6P0C6B7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Igsf6P0C6B7 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Igsf6P0C6B7 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Igsf6P0C6B7 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Igsf6P0C6B7 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Igsf6P0C6B7 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Igsf6P0C6B7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Igsf6P0C6B7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Igsf6P0C6B7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Igsf6P0C6B7 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Igsf6P0C6B7 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Igsf6P0C6B7 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Igsf6P0C6B7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Igsf6P0C6B7 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Igsf6P0C6B7 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Igsf6P0C6B7 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Igsf6P0C6B7 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Igsf6P0C6B7 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Igsf6P0C6B7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Igsf6P0C6B7 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Igsf6P0C6B7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Igsf6P0C6B7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Igsf6P0C6B7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Igsf6P0C6B7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Igsf6P0C6B7 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Igsf6P0C6B7 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Igsf6P0C6B7 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Igsf6P0C6B7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Igsf6P0C6B7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Igsf6P0C6B7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Igsf6P0C6B7 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Igsf6P0C6B7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Igsf6P0C6B7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Igsf6P0C6B7 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Igsf6P0C6B7 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Igsf6P0C6B7 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Igsf6P0C6B7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Igsf6P0C6B7 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Igsf6P0C6B7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Igsf6P0C6B7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Igsf6P0C6B7 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Igsf6P0C6B7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Igsf6P0C6B7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Igsf6P0C6B7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Igsf6P0C6B7 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Igsf6P0C6B7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Igsf6P0C6B7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Igsf6P0C6B7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Igsf6P0C6B7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Igsf6P0C6B7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Igsf6P0C6B7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Igsf6P0C6B7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Igsf6P0C6B7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Igsf6P0C6B7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Igsf6P0C6B7 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Igsf6P0C6B7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Igsf6P0C6B7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Igsf6P0C6B7 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Igsf6P0C6B7 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Igsf6P0C6B7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Igsf6P0C6B7 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Igsf6P0C6B7 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Igsf6P0C6B7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Igsf6P0C6B7 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Igsf6P0C6B7 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Igsf6P0C6B7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Igsf6P0C6B7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Igsf6P0C6B7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Igsf6P0C6B7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Igsf6P0C6B7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Igsf6P0C6B7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Igsf6P0C6B7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Igsf6P0C6B7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Igsf6P0C6B7 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Igsf6P0C6B7 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Igsf6P0C6B7 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Igsf6P0C6B7 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Igsf6P0C6B7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Igsf6P0C6B7 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Igsf6P0C6B7 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Igsf6P0C6B7 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Igsf6P0C6B7 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Igsf6P0C6B7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Igsf6P0C6B7 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Igsf6P0C6B7 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms