Protein–RNA interactions for Protein: P0C1T1

Hoxb2, Homeobox protein Hox-B2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb2P0C1T1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxb2P0C1T1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxb2P0C1T1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxb2P0C1T1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxb2P0C1T1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxb2P0C1T1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxb2P0C1T1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxb2P0C1T1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxb2P0C1T1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxb2P0C1T1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxb2P0C1T1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxb2P0C1T1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxb2P0C1T1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxb2P0C1T1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxb2P0C1T1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxb2P0C1T1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxb2P0C1T1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxb2P0C1T1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxb2P0C1T1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxb2P0C1T1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxb2P0C1T1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxb2P0C1T1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxb2P0C1T1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxb2P0C1T1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxb2P0C1T1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxb2P0C1T1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxb2P0C1T1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxb2P0C1T1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxb2P0C1T1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxb2P0C1T1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxb2P0C1T1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxb2P0C1T1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxb2P0C1T1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxb2P0C1T1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxb2P0C1T1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxb2P0C1T1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxb2P0C1T1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxb2P0C1T1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxb2P0C1T1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxb2P0C1T1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxb2P0C1T1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxb2P0C1T1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxb2P0C1T1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxb2P0C1T1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxb2P0C1T1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxb2P0C1T1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxb2P0C1T1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxb2P0C1T1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxb2P0C1T1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxb2P0C1T1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxb2P0C1T1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxb2P0C1T1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxb2P0C1T1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxb2P0C1T1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxb2P0C1T1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Hoxb2P0C1T1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Hoxb2P0C1T1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxb2P0C1T1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxb2P0C1T1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxb2P0C1T1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxb2P0C1T1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxb2P0C1T1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxb2P0C1T1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxb2P0C1T1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxb2P0C1T1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxb2P0C1T1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxb2P0C1T1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxb2P0C1T1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxb2P0C1T1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxb2P0C1T1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxb2P0C1T1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxb2P0C1T1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxb2P0C1T1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxb2P0C1T1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxb2P0C1T1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxb2P0C1T1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxb2P0C1T1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxb2P0C1T1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxb2P0C1T1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxb2P0C1T1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxb2P0C1T1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxb2P0C1T1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxb2P0C1T1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxb2P0C1T1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxb2P0C1T1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxb2P0C1T1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxb2P0C1T1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxb2P0C1T1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxb2P0C1T1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxb2P0C1T1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxb2P0C1T1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxb2P0C1T1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxb2P0C1T1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxb2P0C1T1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxb2P0C1T1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxb2P0C1T1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxb2P0C1T1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxb2P0C1T1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxb2P0C1T1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxb2P0C1T1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms