Protein–RNA interactions for Protein: P09925

Surf1, Surfeit locus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf1P09925 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Surf1P09925 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Surf1P09925 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Surf1P09925 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Surf1P09925 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Surf1P09925 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Surf1P09925 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Surf1P09925 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Surf1P09925 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Surf1P09925 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Surf1P09925 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Surf1P09925 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Surf1P09925 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Surf1P09925 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Surf1P09925 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Surf1P09925 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Surf1P09925 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Surf1P09925 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Surf1P09925 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Surf1P09925 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Surf1P09925 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Surf1P09925 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Surf1P09925 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Surf1P09925 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Surf1P09925 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Surf1P09925 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Surf1P09925 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Surf1P09925 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Surf1P09925 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Surf1P09925 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Surf1P09925 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Surf1P09925 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Surf1P09925 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Surf1P09925 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Surf1P09925 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Surf1P09925 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Surf1P09925 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Surf1P09925 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Surf1P09925 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Surf1P09925 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Surf1P09925 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Surf1P09925 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Surf1P09925 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Surf1P09925 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Surf1P09925 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Surf1P09925 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Surf1P09925 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Surf1P09925 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Surf1P09925 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Surf1P09925 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Surf1P09925 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Surf1P09925 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Surf1P09925 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Surf1P09925 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Surf1P09925 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Surf1P09925 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Surf1P09925 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Surf1P09925 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Surf1P09925 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Surf1P09925 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Surf1P09925 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Surf1P09925 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Surf1P09925 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Surf1P09925 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Surf1P09925 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Surf1P09925 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Surf1P09925 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Surf1P09925 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Surf1P09925 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Surf1P09925 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Surf1P09925 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Surf1P09925 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Surf1P09925 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Surf1P09925 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Surf1P09925 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Surf1P09925 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Surf1P09925 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Surf1P09925 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Surf1P09925 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Surf1P09925 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Surf1P09925 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Surf1P09925 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Surf1P09925 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Surf1P09925 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Surf1P09925 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Surf1P09925 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Surf1P09925 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Surf1P09925 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Surf1P09925 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Surf1P09925 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Surf1P09925 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Surf1P09925 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Surf1P09925 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Surf1P09925 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Surf1P09925 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Surf1P09925 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Surf1P09925 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Surf1P09925 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Surf1P09925 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Surf1P09925 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms