Protein–RNA interactions for Protein: P09920

Csf3, Granulocyte colony-stimulating factor, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf3P09920 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Csf3P09920 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Csf3P09920 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Csf3P09920 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Csf3P09920 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Csf3P09920 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Csf3P09920 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Csf3P09920 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Csf3P09920 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Csf3P09920 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Csf3P09920 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Csf3P09920 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Csf3P09920 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Csf3P09920 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Csf3P09920 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Csf3P09920 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Csf3P09920 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Csf3P09920 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Csf3P09920 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Csf3P09920 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Csf3P09920 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Csf3P09920 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Csf3P09920 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Csf3P09920 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Csf3P09920 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Csf3P09920 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Csf3P09920 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Csf3P09920 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Csf3P09920 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Csf3P09920 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Csf3P09920 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Csf3P09920 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Csf3P09920 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Csf3P09920 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Csf3P09920 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csf3P09920 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csf3P09920 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csf3P09920 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csf3P09920 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csf3P09920 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csf3P09920 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csf3P09920 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csf3P09920 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csf3P09920 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csf3P09920 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Csf3P09920 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Csf3P09920 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Csf3P09920 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Csf3P09920 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Csf3P09920 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Csf3P09920 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Csf3P09920 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Csf3P09920 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Csf3P09920 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Csf3P09920 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Csf3P09920 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Csf3P09920 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Csf3P09920 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Csf3P09920 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Csf3P09920 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Csf3P09920 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Csf3P09920 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Csf3P09920 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Csf3P09920 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csf3P09920 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csf3P09920 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csf3P09920 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csf3P09920 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csf3P09920 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Csf3P09920 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csf3P09920 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csf3P09920 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csf3P09920 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csf3P09920 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csf3P09920 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csf3P09920 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csf3P09920 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csf3P09920 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csf3P09920 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csf3P09920 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csf3P09920 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csf3P09920 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csf3P09920 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csf3P09920 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csf3P09920 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csf3P09920 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csf3P09920 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Csf3P09920 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csf3P09920 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csf3P09920 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csf3P09920 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csf3P09920 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csf3P09920 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csf3P09920 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csf3P09920 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csf3P09920 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csf3P09920 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csf3P09920 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csf3P09920 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csf3P09920 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms