Protein–RNA interactions for Protein: P09633

Hoxc9, Homeobox protein Hox-C9, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc9P09633 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Hoxc9P09633 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Hoxc9P09633 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Hoxc9P09633 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Hoxc9P09633 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Hoxc9P09633 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Hoxc9P09633 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Hoxc9P09633 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Hoxc9P09633 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Hoxc9P09633 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Hoxc9P09633 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Hoxc9P09633 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Hoxc9P09633 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hoxc9P09633 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hoxc9P09633 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hoxc9P09633 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hoxc9P09633 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hoxc9P09633 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hoxc9P09633 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hoxc9P09633 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hoxc9P09633 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hoxc9P09633 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Hoxc9P09633 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hoxc9P09633 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hoxc9P09633 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hoxc9P09633 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hoxc9P09633 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hoxc9P09633 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hoxc9P09633 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hoxc9P09633 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hoxc9P09633 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hoxc9P09633 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hoxc9P09633 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hoxc9P09633 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hoxc9P09633 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hoxc9P09633 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Hoxc9P09633 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hoxc9P09633 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Hoxc9P09633 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Hoxc9P09633 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hoxc9P09633 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hoxc9P09633 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hoxc9P09633 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Hoxc9P09633 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hoxc9P09633 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hoxc9P09633 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hoxc9P09633 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hoxc9P09633 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Hoxc9P09633 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hoxc9P09633 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hoxc9P09633 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hoxc9P09633 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Hoxc9P09633 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Hoxc9P09633 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Hoxc9P09633 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Hoxc9P09633 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Hoxc9P09633 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Hoxc9P09633 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Hoxc9P09633 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Hoxc9P09633 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Hoxc9P09633 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Hoxc9P09633 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hoxc9P09633 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hoxc9P09633 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hoxc9P09633 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hoxc9P09633 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hoxc9P09633 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hoxc9P09633 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hoxc9P09633 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hoxc9P09633 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hoxc9P09633 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hoxc9P09633 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hoxc9P09633 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Hoxc9P09633 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hoxc9P09633 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hoxc9P09633 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hoxc9P09633 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hoxc9P09633 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hoxc9P09633 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Hoxc9P09633 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Hoxc9P09633 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Hoxc9P09633 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Hoxc9P09633 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Hoxc9P09633 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Hoxc9P09633 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Hoxc9P09633 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Hoxc9P09633 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Hoxc9P09633 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Hoxc9P09633 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Hoxc9P09633 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Hoxc9P09633 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Hoxc9P09633 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Hoxc9P09633 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Hoxc9P09633 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Hoxc9P09633 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Hoxc9P09633 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Hoxc9P09633 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Hoxc9P09633 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Hoxc9P09633 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Hoxc9P09633 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms