Protein–RNA interactions for Protein: P09225

Lta, Lymphotoxin-alpha, mousemouse

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Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtaP09225 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
LtaP09225 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LtaP09225 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LtaP09225 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LtaP09225 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LtaP09225 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LtaP09225 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LtaP09225 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LtaP09225 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LtaP09225 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LtaP09225 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LtaP09225 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LtaP09225 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LtaP09225 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LtaP09225 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LtaP09225 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LtaP09225 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LtaP09225 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LtaP09225 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LtaP09225 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LtaP09225 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LtaP09225 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LtaP09225 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LtaP09225 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LtaP09225 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LtaP09225 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LtaP09225 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LtaP09225 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LtaP09225 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LtaP09225 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LtaP09225 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LtaP09225 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LtaP09225 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LtaP09225 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LtaP09225 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LtaP09225 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LtaP09225 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LtaP09225 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LtaP09225 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LtaP09225 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LtaP09225 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LtaP09225 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LtaP09225 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LtaP09225 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LtaP09225 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LtaP09225 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LtaP09225 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LtaP09225 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LtaP09225 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LtaP09225 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LtaP09225 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LtaP09225 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LtaP09225 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LtaP09225 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LtaP09225 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LtaP09225 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LtaP09225 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LtaP09225 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LtaP09225 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LtaP09225 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LtaP09225 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LtaP09225 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LtaP09225 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LtaP09225 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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LtaP09225 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LtaP09225 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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LtaP09225 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LtaP09225 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LtaP09225 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LtaP09225 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LtaP09225 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LtaP09225 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LtaP09225 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LtaP09225 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LtaP09225 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LtaP09225 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LtaP09225 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LtaP09225 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LtaP09225 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LtaP09225 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LtaP09225 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LtaP09225 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LtaP09225 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LtaP09225 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LtaP09225 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LtaP09225 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LtaP09225 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LtaP09225 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LtaP09225 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LtaP09225 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LtaP09225 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LtaP09225 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LtaP09225 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LtaP09225 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms