Protein–RNA interactions for Protein: P08551

Nefl, Neurofilament light polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeflP08551 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NeflP08551 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NeflP08551 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NeflP08551 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NeflP08551 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NeflP08551 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NeflP08551 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NeflP08551 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NeflP08551 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NeflP08551 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NeflP08551 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NeflP08551 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NeflP08551 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NeflP08551 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NeflP08551 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NeflP08551 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NeflP08551 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NeflP08551 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NeflP08551 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NeflP08551 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NeflP08551 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NeflP08551 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NeflP08551 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NeflP08551 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NeflP08551 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NeflP08551 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NeflP08551 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NeflP08551 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
NeflP08551 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NeflP08551 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NeflP08551 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NeflP08551 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NeflP08551 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NeflP08551 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NeflP08551 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NeflP08551 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NeflP08551 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NeflP08551 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NeflP08551 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NeflP08551 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NeflP08551 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NeflP08551 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NeflP08551 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NeflP08551 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NeflP08551 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NeflP08551 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NeflP08551 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NeflP08551 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NeflP08551 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NeflP08551 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NeflP08551 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NeflP08551 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NeflP08551 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NeflP08551 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NeflP08551 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
NeflP08551 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NeflP08551 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NeflP08551 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NeflP08551 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NeflP08551 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NeflP08551 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NeflP08551 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NeflP08551 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NeflP08551 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NeflP08551 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NeflP08551 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NeflP08551 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NeflP08551 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NeflP08551 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NeflP08551 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NeflP08551 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NeflP08551 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NeflP08551 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NeflP08551 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NeflP08551 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
NeflP08551 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NeflP08551 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NeflP08551 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NeflP08551 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NeflP08551 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NeflP08551 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NeflP08551 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NeflP08551 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NeflP08551 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NeflP08551 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NeflP08551 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NeflP08551 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NeflP08551 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NeflP08551 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NeflP08551 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NeflP08551 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NeflP08551 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NeflP08551 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NeflP08551 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NeflP08551 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
NeflP08551 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NeflP08551 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NeflP08551 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NeflP08551 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NeflP08551 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 374.4 ms