Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spta1P08032 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spta1P08032 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spta1P08032 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spta1P08032 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spta1P08032 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spta1P08032 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spta1P08032 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spta1P08032 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spta1P08032 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Spta1P08032 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Spta1P08032 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spta1P08032 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spta1P08032 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spta1P08032 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spta1P08032 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spta1P08032 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Spta1P08032 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spta1P08032 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spta1P08032 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spta1P08032 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spta1P08032 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spta1P08032 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spta1P08032 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Spta1P08032 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spta1P08032 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spta1P08032 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spta1P08032 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spta1P08032 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Spta1P08032 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spta1P08032 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spta1P08032 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spta1P08032 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spta1P08032 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spta1P08032 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spta1P08032 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spta1P08032 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Spta1P08032 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Spta1P08032 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Spta1P08032 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Spta1P08032 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spta1P08032 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spta1P08032 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spta1P08032 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Spta1P08032 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spta1P08032 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spta1P08032 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spta1P08032 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spta1P08032 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spta1P08032 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spta1P08032 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spta1P08032 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spta1P08032 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spta1P08032 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spta1P08032 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spta1P08032 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spta1P08032 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Spta1P08032 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spta1P08032 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spta1P08032 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spta1P08032 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spta1P08032 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spta1P08032 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Spta1P08032 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spta1P08032 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spta1P08032 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spta1P08032 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spta1P08032 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spta1P08032 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spta1P08032 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spta1P08032 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spta1P08032 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spta1P08032 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spta1P08032 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spta1P08032 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spta1P08032 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Spta1P08032 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spta1P08032 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spta1P08032 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spta1P08032 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Spta1P08032 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spta1P08032 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spta1P08032 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spta1P08032 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Spta1P08032 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spta1P08032 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spta1P08032 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spta1P08032 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Spta1P08032 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spta1P08032 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spta1P08032 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spta1P08032 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spta1P08032 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spta1P08032 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spta1P08032 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spta1P08032 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spta1P08032 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spta1P08032 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spta1P08032 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spta1P08032 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms