Protein–RNA interactions for Protein: P07350

Ifna6, Interferon alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna6P07350 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifna6P07350 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifna6P07350 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifna6P07350 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifna6P07350 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifna6P07350 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifna6P07350 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifna6P07350 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifna6P07350 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifna6P07350 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifna6P07350 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifna6P07350 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifna6P07350 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifna6P07350 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifna6P07350 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifna6P07350 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifna6P07350 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifna6P07350 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifna6P07350 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifna6P07350 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifna6P07350 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifna6P07350 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifna6P07350 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifna6P07350 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifna6P07350 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifna6P07350 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifna6P07350 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifna6P07350 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifna6P07350 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifna6P07350 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifna6P07350 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifna6P07350 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifna6P07350 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifna6P07350 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifna6P07350 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifna6P07350 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifna6P07350 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifna6P07350 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifna6P07350 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifna6P07350 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifna6P07350 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ifna6P07350 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifna6P07350 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifna6P07350 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifna6P07350 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifna6P07350 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifna6P07350 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifna6P07350 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifna6P07350 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifna6P07350 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifna6P07350 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifna6P07350 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifna6P07350 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifna6P07350 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifna6P07350 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifna6P07350 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifna6P07350 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifna6P07350 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifna6P07350 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifna6P07350 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifna6P07350 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifna6P07350 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifna6P07350 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifna6P07350 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifna6P07350 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifna6P07350 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifna6P07350 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifna6P07350 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifna6P07350 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifna6P07350 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifna6P07350 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifna6P07350 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifna6P07350 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifna6P07350 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifna6P07350 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifna6P07350 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifna6P07350 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifna6P07350 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifna6P07350 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifna6P07350 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifna6P07350 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifna6P07350 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifna6P07350 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifna6P07350 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifna6P07350 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifna6P07350 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifna6P07350 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifna6P07350 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifna6P07350 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifna6P07350 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifna6P07350 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifna6P07350 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifna6P07350 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifna6P07350 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifna6P07350 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifna6P07350 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifna6P07350 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifna6P07350 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifna6P07350 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifna6P07350 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms