Protein–RNA interactions for Protein: P04235

Cd3d, T-cell surface glycoprotein CD3 delta chain, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3dP04235 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cd3dP04235 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cd3dP04235 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cd3dP04235 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cd3dP04235 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cd3dP04235 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cd3dP04235 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cd3dP04235 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cd3dP04235 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cd3dP04235 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cd3dP04235 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cd3dP04235 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cd3dP04235 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cd3dP04235 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cd3dP04235 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cd3dP04235 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cd3dP04235 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cd3dP04235 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cd3dP04235 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cd3dP04235 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cd3dP04235 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cd3dP04235 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cd3dP04235 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cd3dP04235 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cd3dP04235 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cd3dP04235 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cd3dP04235 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cd3dP04235 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cd3dP04235 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cd3dP04235 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cd3dP04235 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cd3dP04235 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cd3dP04235 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Cd3dP04235 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cd3dP04235 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cd3dP04235 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cd3dP04235 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cd3dP04235 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cd3dP04235 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cd3dP04235 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cd3dP04235 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cd3dP04235 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cd3dP04235 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Cd3dP04235 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cd3dP04235 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cd3dP04235 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cd3dP04235 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cd3dP04235 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cd3dP04235 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cd3dP04235 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Cd3dP04235 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cd3dP04235 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Cd3dP04235 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cd3dP04235 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cd3dP04235 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cd3dP04235 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cd3dP04235 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cd3dP04235 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Cd3dP04235 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cd3dP04235 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cd3dP04235 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cd3dP04235 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cd3dP04235 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cd3dP04235 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cd3dP04235 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cd3dP04235 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cd3dP04235 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cd3dP04235 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cd3dP04235 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cd3dP04235 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cd3dP04235 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cd3dP04235 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cd3dP04235 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cd3dP04235 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cd3dP04235 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cd3dP04235 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cd3dP04235 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cd3dP04235 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cd3dP04235 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Cd3dP04235 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cd3dP04235 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cd3dP04235 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cd3dP04235 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cd3dP04235 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cd3dP04235 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cd3dP04235 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cd3dP04235 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cd3dP04235 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cd3dP04235 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cd3dP04235 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cd3dP04235 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cd3dP04235 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Cd3dP04235 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cd3dP04235 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cd3dP04235 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cd3dP04235 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Cd3dP04235 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cd3dP04235 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cd3dP04235 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cd3dP04235 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms