Protein–RNA interactions for Protein: P01921

H2-Ab1, H-2 class II histocompatibility antigen, A-D beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Ab1P01921 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-Ab1P01921 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-Ab1P01921 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-Ab1P01921 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-Ab1P01921 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-Ab1P01921 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-Ab1P01921 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-Ab1P01921 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
H2-Ab1P01921 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-Ab1P01921 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-Ab1P01921 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-Ab1P01921 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-Ab1P01921 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-Ab1P01921 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-Ab1P01921 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-Ab1P01921 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2-Ab1P01921 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-Ab1P01921 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-Ab1P01921 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-Ab1P01921 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-Ab1P01921 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-Ab1P01921 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-Ab1P01921 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-Ab1P01921 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-Ab1P01921 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2-Ab1P01921 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
H2-Ab1P01921 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-Ab1P01921 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-Ab1P01921 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-Ab1P01921 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-Ab1P01921 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-Ab1P01921 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-Ab1P01921 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-Ab1P01921 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-Ab1P01921 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-Ab1P01921 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2-Ab1P01921 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-Ab1P01921 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-Ab1P01921 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-Ab1P01921 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-Ab1P01921 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-Ab1P01921 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-Ab1P01921 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-Ab1P01921 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-Ab1P01921 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-Ab1P01921 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-Ab1P01921 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-Ab1P01921 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-Ab1P01921 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-Ab1P01921 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-Ab1P01921 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2-Ab1P01921 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-Ab1P01921 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-Ab1P01921 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-Ab1P01921 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-Ab1P01921 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-Ab1P01921 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-Ab1P01921 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-Ab1P01921 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-Ab1P01921 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-Ab1P01921 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-Ab1P01921 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2-Ab1P01921 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-Ab1P01921 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-Ab1P01921 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-Ab1P01921 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-Ab1P01921 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-Ab1P01921 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-Ab1P01921 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-Ab1P01921 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-Ab1P01921 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-Ab1P01921 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-Ab1P01921 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-Ab1P01921 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-Ab1P01921 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-Ab1P01921 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-Ab1P01921 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-Ab1P01921 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-Ab1P01921 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-Ab1P01921 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-Ab1P01921 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-Ab1P01921 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-Ab1P01921 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-Ab1P01921 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-Ab1P01921 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-Ab1P01921 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-Ab1P01921 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-Ab1P01921 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-Ab1P01921 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-Ab1P01921 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-Ab1P01921 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-Ab1P01921 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-Ab1P01921 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-Ab1P01921 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-Ab1P01921 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-Ab1P01921 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-Ab1P01921 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-Ab1P01921 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-Ab1P01921 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-Ab1P01921 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms