Protein–RNA interactions for Protein: P01915

H-2 class II histocompatibility antigen, E-D beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01915 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01915 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01915 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01915 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01915 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01915 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01915 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
P01915 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01915 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01915 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01915 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01915 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01915 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01915 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01915 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01915 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01915 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01915 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01915 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01915 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01915 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01915 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01915 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01915 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01915 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01915 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01915 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01915 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01915 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01915 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01915 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01915 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01915 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01915 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01915 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01915 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01915 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01915 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01915 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01915 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01915 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01915 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01915 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01915 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01915 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
P01915 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01915 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01915 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01915 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01915 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01915 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01915 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01915 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01915 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01915 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01915 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01915 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01915 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01915 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01915 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01915 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01915 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01915 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01915 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
P01915 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01915 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01915 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01915 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01915 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01915 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01915 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01915 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01915 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01915 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01915 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01915 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01915 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01915 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01915 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01915 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01915 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01915 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01915 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01915 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01915 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01915 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01915 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01915 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01915 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01915 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01915 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01915 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01915 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01915 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01915 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01915 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01915 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01915 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01915 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01915 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms