Protein–RNA interactions for Protein: P01910

H2-Aa, H-2 class II histocompatibility antigen, A-K alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-AaP01910 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-AaP01910 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-AaP01910 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-AaP01910 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-AaP01910 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-AaP01910 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-AaP01910 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-AaP01910 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-AaP01910 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-AaP01910 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-AaP01910 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-AaP01910 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-AaP01910 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-AaP01910 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-AaP01910 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-AaP01910 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-AaP01910 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-AaP01910 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-AaP01910 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-AaP01910 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-AaP01910 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-AaP01910 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-AaP01910 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-AaP01910 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-AaP01910 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-AaP01910 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-AaP01910 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-AaP01910 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-AaP01910 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-AaP01910 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-AaP01910 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
H2-AaP01910 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
H2-AaP01910 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
H2-AaP01910 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
H2-AaP01910 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-AaP01910 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-AaP01910 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-AaP01910 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-AaP01910 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-AaP01910 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-AaP01910 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-AaP01910 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-AaP01910 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-AaP01910 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-AaP01910 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-AaP01910 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-AaP01910 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-AaP01910 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-AaP01910 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-AaP01910 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-AaP01910 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-AaP01910 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-AaP01910 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-AaP01910 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-AaP01910 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-AaP01910 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-AaP01910 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-AaP01910 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-AaP01910 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-AaP01910 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-AaP01910 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-AaP01910 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-AaP01910 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-AaP01910 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-AaP01910 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-AaP01910 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-AaP01910 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-AaP01910 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-AaP01910 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-AaP01910 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-AaP01910 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-AaP01910 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-AaP01910 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-AaP01910 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-AaP01910 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-AaP01910 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-AaP01910 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-AaP01910 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-AaP01910 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-AaP01910 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-AaP01910 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-AaP01910 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-AaP01910 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-AaP01910 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-AaP01910 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-AaP01910 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-AaP01910 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-AaP01910 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-AaP01910 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-AaP01910 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-AaP01910 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-AaP01910 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-AaP01910 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-AaP01910 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-AaP01910 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-AaP01910 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2-AaP01910 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2-AaP01910 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2-AaP01910 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2-AaP01910 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms