Protein–RNA interactions for Protein: P01660

Ig kappa chain V-III region PC 3741/TEPC 111, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01660 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01660 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
P01660 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01660 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01660 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01660 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01660 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01660 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
P01660 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01660 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01660 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01660 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01660 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01660 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01660 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01660 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01660 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01660 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01660 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01660 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01660 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01660 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01660 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01660 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01660 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01660 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01660 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01660 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01660 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01660 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01660 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01660 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01660 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
P01660 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01660 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01660 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01660 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01660 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01660 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01660 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01660 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01660 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01660 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01660 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01660 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01660 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01660 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01660 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01660 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01660 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01660 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01660 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01660 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01660 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01660 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01660 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01660 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01660 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01660 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01660 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01660 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
P01660 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01660 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01660 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01660 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01660 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01660 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01660 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01660 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01660 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01660 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
P01660 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
P01660 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01660 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01660 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01660 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01660 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01660 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01660 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01660 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01660 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01660 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01660 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01660 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01660 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01660 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01660 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
P01660 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01660 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01660 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01660 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01660 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01660 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01660 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01660 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01660 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01660 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01660 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01660 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01660 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms