Protein–RNA interactions for Protein: P01633

Igk-V19-17, Ig kappa chain V19-17, mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igk-V19-17P01633 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Igk-V19-17P01633 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Igk-V19-17P01633 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Igk-V19-17P01633 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Igk-V19-17P01633 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Igk-V19-17P01633 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Igk-V19-17P01633 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Igk-V19-17P01633 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Igk-V19-17P01633 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Igk-V19-17P01633 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Igk-V19-17P01633 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Igk-V19-17P01633 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Igk-V19-17P01633 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Igk-V19-17P01633 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Igk-V19-17P01633 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Igk-V19-17P01633 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Igk-V19-17P01633 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Igk-V19-17P01633 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Igk-V19-17P01633 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Igk-V19-17P01633 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Igk-V19-17P01633 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Igk-V19-17P01633 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Igk-V19-17P01633 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Igk-V19-17P01633 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Igk-V19-17P01633 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Igk-V19-17P01633 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Igk-V19-17P01633 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Igk-V19-17P01633 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Igk-V19-17P01633 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Igk-V19-17P01633 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Igk-V19-17P01633 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Igk-V19-17P01633 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Igk-V19-17P01633 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Igk-V19-17P01633 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Igk-V19-17P01633 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Igk-V19-17P01633 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Igk-V19-17P01633 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Igk-V19-17P01633 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Igk-V19-17P01633 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Igk-V19-17P01633 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Igk-V19-17P01633 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Igk-V19-17P01633 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Igk-V19-17P01633 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Igk-V19-17P01633 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Igk-V19-17P01633 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Igk-V19-17P01633 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Igk-V19-17P01633 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Igk-V19-17P01633 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Igk-V19-17P01633 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Igk-V19-17P01633 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Igk-V19-17P01633 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Igk-V19-17P01633 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Igk-V19-17P01633 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Igk-V19-17P01633 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Igk-V19-17P01633 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Igk-V19-17P01633 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Igk-V19-17P01633 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Igk-V19-17P01633 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Igk-V19-17P01633 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Igk-V19-17P01633 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Igk-V19-17P01633 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Igk-V19-17P01633 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Igk-V19-17P01633 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Igk-V19-17P01633 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Igk-V19-17P01633 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Igk-V19-17P01633 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Igk-V19-17P01633 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Igk-V19-17P01633 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Igk-V19-17P01633 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Igk-V19-17P01633 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Igk-V19-17P01633 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Igk-V19-17P01633 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Igk-V19-17P01633 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Igk-V19-17P01633 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Igk-V19-17P01633 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Igk-V19-17P01633 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Igk-V19-17P01633 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Igk-V19-17P01633 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Igk-V19-17P01633 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Igk-V19-17P01633 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Igk-V19-17P01633 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Igk-V19-17P01633 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Igk-V19-17P01633 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Igk-V19-17P01633 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Igk-V19-17P01633 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Igk-V19-17P01633 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Igk-V19-17P01633 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Igk-V19-17P01633 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Igk-V19-17P01633 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Igk-V19-17P01633 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Igk-V19-17P01633 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Igk-V19-17P01633 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Igk-V19-17P01633 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Igk-V19-17P01633 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Igk-V19-17P01633 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Igk-V19-17P01633 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Igk-V19-17P01633 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Igk-V19-17P01633 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Igk-V19-17P01633 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Igk-V19-17P01633 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms