Protein–RNA interactions for Protein: P00848

Mtatp6, ATP synthase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtatp6P00848 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mtatp6P00848 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mtatp6P00848 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mtatp6P00848 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mtatp6P00848 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mtatp6P00848 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mtatp6P00848 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mtatp6P00848 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mtatp6P00848 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mtatp6P00848 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mtatp6P00848 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mtatp6P00848 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mtatp6P00848 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mtatp6P00848 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mtatp6P00848 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mtatp6P00848 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mtatp6P00848 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mtatp6P00848 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mtatp6P00848 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mtatp6P00848 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mtatp6P00848 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mtatp6P00848 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mtatp6P00848 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mtatp6P00848 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mtatp6P00848 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mtatp6P00848 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mtatp6P00848 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mtatp6P00848 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mtatp6P00848 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mtatp6P00848 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mtatp6P00848 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mtatp6P00848 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mtatp6P00848 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mtatp6P00848 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mtatp6P00848 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mtatp6P00848 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mtatp6P00848 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mtatp6P00848 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mtatp6P00848 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mtatp6P00848 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mtatp6P00848 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mtatp6P00848 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mtatp6P00848 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mtatp6P00848 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mtatp6P00848 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mtatp6P00848 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mtatp6P00848 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mtatp6P00848 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mtatp6P00848 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mtatp6P00848 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mtatp6P00848 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mtatp6P00848 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Mtatp6P00848 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mtatp6P00848 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mtatp6P00848 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mtatp6P00848 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mtatp6P00848 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mtatp6P00848 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mtatp6P00848 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mtatp6P00848 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mtatp6P00848 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mtatp6P00848 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mtatp6P00848 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mtatp6P00848 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mtatp6P00848 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mtatp6P00848 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mtatp6P00848 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mtatp6P00848 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mtatp6P00848 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mtatp6P00848 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mtatp6P00848 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mtatp6P00848 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mtatp6P00848 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mtatp6P00848 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mtatp6P00848 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mtatp6P00848 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mtatp6P00848 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mtatp6P00848 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mtatp6P00848 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mtatp6P00848 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mtatp6P00848 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mtatp6P00848 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mtatp6P00848 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mtatp6P00848 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mtatp6P00848 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mtatp6P00848 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mtatp6P00848 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mtatp6P00848 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mtatp6P00848 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mtatp6P00848 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Mtatp6P00848 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mtatp6P00848 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mtatp6P00848 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mtatp6P00848 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mtatp6P00848 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mtatp6P00848 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mtatp6P00848 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Mtatp6P00848 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Mtatp6P00848 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Mtatp6P00848 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms