Protein–RNA interactions for Protein: P00405

Mtco2, Cytochrome c oxidase subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtco2P00405 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mtco2P00405 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mtco2P00405 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mtco2P00405 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mtco2P00405 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mtco2P00405 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mtco2P00405 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mtco2P00405 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mtco2P00405 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mtco2P00405 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mtco2P00405 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mtco2P00405 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mtco2P00405 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mtco2P00405 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mtco2P00405 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Mtco2P00405 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mtco2P00405 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mtco2P00405 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mtco2P00405 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mtco2P00405 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mtco2P00405 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mtco2P00405 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mtco2P00405 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mtco2P00405 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mtco2P00405 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mtco2P00405 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mtco2P00405 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mtco2P00405 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mtco2P00405 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mtco2P00405 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mtco2P00405 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mtco2P00405 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mtco2P00405 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mtco2P00405 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mtco2P00405 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mtco2P00405 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mtco2P00405 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mtco2P00405 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mtco2P00405 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mtco2P00405 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mtco2P00405 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mtco2P00405 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mtco2P00405 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mtco2P00405 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mtco2P00405 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mtco2P00405 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mtco2P00405 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mtco2P00405 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mtco2P00405 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mtco2P00405 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mtco2P00405 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mtco2P00405 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mtco2P00405 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mtco2P00405 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mtco2P00405 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mtco2P00405 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mtco2P00405 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mtco2P00405 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mtco2P00405 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mtco2P00405 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mtco2P00405 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mtco2P00405 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mtco2P00405 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Mtco2P00405 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mtco2P00405 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mtco2P00405 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mtco2P00405 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mtco2P00405 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mtco2P00405 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mtco2P00405 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mtco2P00405 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mtco2P00405 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mtco2P00405 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mtco2P00405 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mtco2P00405 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mtco2P00405 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mtco2P00405 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mtco2P00405 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mtco2P00405 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mtco2P00405 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mtco2P00405 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mtco2P00405 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mtco2P00405 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mtco2P00405 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mtco2P00405 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mtco2P00405 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mtco2P00405 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mtco2P00405 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mtco2P00405 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mtco2P00405 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mtco2P00405 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mtco2P00405 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mtco2P00405 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mtco2P00405 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mtco2P00405 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mtco2P00405 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mtco2P00405 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mtco2P00405 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mtco2P00405 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mtco2P00405 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms