Protein–RNA interactions for Protein: O89112

Lancl1, LanC-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lancl1O89112 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lancl1O89112 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lancl1O89112 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lancl1O89112 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lancl1O89112 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lancl1O89112 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lancl1O89112 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lancl1O89112 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lancl1O89112 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lancl1O89112 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lancl1O89112 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lancl1O89112 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lancl1O89112 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lancl1O89112 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lancl1O89112 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lancl1O89112 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lancl1O89112 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lancl1O89112 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lancl1O89112 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lancl1O89112 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Lancl1O89112 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lancl1O89112 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lancl1O89112 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lancl1O89112 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lancl1O89112 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lancl1O89112 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lancl1O89112 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lancl1O89112 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lancl1O89112 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lancl1O89112 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lancl1O89112 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lancl1O89112 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lancl1O89112 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lancl1O89112 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lancl1O89112 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lancl1O89112 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lancl1O89112 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lancl1O89112 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lancl1O89112 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Lancl1O89112 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lancl1O89112 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Lancl1O89112 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lancl1O89112 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lancl1O89112 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lancl1O89112 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lancl1O89112 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lancl1O89112 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lancl1O89112 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lancl1O89112 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lancl1O89112 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lancl1O89112 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lancl1O89112 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lancl1O89112 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lancl1O89112 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lancl1O89112 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lancl1O89112 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lancl1O89112 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lancl1O89112 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lancl1O89112 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lancl1O89112 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lancl1O89112 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lancl1O89112 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lancl1O89112 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lancl1O89112 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lancl1O89112 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lancl1O89112 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lancl1O89112 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lancl1O89112 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lancl1O89112 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lancl1O89112 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lancl1O89112 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lancl1O89112 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lancl1O89112 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lancl1O89112 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lancl1O89112 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lancl1O89112 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lancl1O89112 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lancl1O89112 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lancl1O89112 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lancl1O89112 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lancl1O89112 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lancl1O89112 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lancl1O89112 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lancl1O89112 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lancl1O89112 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lancl1O89112 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lancl1O89112 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lancl1O89112 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Lancl1O89112 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lancl1O89112 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lancl1O89112 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lancl1O89112 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lancl1O89112 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lancl1O89112 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Lancl1O89112 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lancl1O89112 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lancl1O89112 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lancl1O89112 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lancl1O89112 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lancl1O89112 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms