Protein–RNA interactions for Protein: O89026

Robo1, Roundabout homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo1O89026 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Robo1O89026 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Robo1O89026 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Robo1O89026 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Robo1O89026 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Robo1O89026 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Robo1O89026 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Robo1O89026 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Robo1O89026 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Robo1O89026 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Robo1O89026 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Robo1O89026 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Robo1O89026 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Robo1O89026 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Robo1O89026 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Robo1O89026 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Robo1O89026 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Robo1O89026 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Robo1O89026 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Robo1O89026 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Robo1O89026 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Robo1O89026 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Robo1O89026 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Robo1O89026 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Robo1O89026 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Robo1O89026 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Robo1O89026 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Robo1O89026 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Robo1O89026 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Robo1O89026 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Robo1O89026 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Robo1O89026 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Robo1O89026 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Robo1O89026 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Robo1O89026 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Robo1O89026 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Robo1O89026 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Robo1O89026 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Robo1O89026 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Robo1O89026 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Robo1O89026 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Robo1O89026 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Robo1O89026 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Robo1O89026 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Robo1O89026 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Robo1O89026 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Robo1O89026 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Robo1O89026 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Robo1O89026 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Robo1O89026 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Robo1O89026 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Robo1O89026 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Robo1O89026 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Robo1O89026 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Robo1O89026 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Robo1O89026 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Robo1O89026 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Robo1O89026 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Robo1O89026 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Robo1O89026 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Robo1O89026 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Robo1O89026 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Robo1O89026 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Robo1O89026 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Robo1O89026 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Robo1O89026 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Robo1O89026 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Robo1O89026 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Robo1O89026 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Robo1O89026 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Robo1O89026 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Robo1O89026 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Robo1O89026 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Robo1O89026 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Robo1O89026 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Robo1O89026 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Robo1O89026 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Robo1O89026 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Robo1O89026 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Robo1O89026 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Robo1O89026 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Robo1O89026 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Robo1O89026 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Robo1O89026 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Robo1O89026 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Robo1O89026 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Robo1O89026 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Robo1O89026 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Robo1O89026 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Robo1O89026 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Robo1O89026 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Robo1O89026 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Robo1O89026 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Robo1O89026 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Robo1O89026 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Robo1O89026 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Robo1O89026 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Robo1O89026 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Robo1O89026 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Robo1O89026 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms