Protein–RNA interactions for Protein: O88703

Hcn2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn2O88703 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hcn2O88703 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hcn2O88703 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hcn2O88703 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hcn2O88703 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hcn2O88703 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hcn2O88703 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hcn2O88703 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Hcn2O88703 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hcn2O88703 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Hcn2O88703 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Hcn2O88703 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hcn2O88703 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Hcn2O88703 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hcn2O88703 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Hcn2O88703 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hcn2O88703 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hcn2O88703 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hcn2O88703 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hcn2O88703 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hcn2O88703 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hcn2O88703 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hcn2O88703 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hcn2O88703 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hcn2O88703 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hcn2O88703 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hcn2O88703 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hcn2O88703 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hcn2O88703 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hcn2O88703 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hcn2O88703 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hcn2O88703 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hcn2O88703 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hcn2O88703 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hcn2O88703 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hcn2O88703 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hcn2O88703 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hcn2O88703 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hcn2O88703 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hcn2O88703 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hcn2O88703 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hcn2O88703 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hcn2O88703 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hcn2O88703 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hcn2O88703 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hcn2O88703 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hcn2O88703 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hcn2O88703 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hcn2O88703 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hcn2O88703 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hcn2O88703 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hcn2O88703 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hcn2O88703 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hcn2O88703 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hcn2O88703 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hcn2O88703 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hcn2O88703 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hcn2O88703 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hcn2O88703 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hcn2O88703 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hcn2O88703 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Hcn2O88703 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hcn2O88703 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hcn2O88703 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hcn2O88703 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hcn2O88703 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hcn2O88703 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hcn2O88703 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Hcn2O88703 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hcn2O88703 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hcn2O88703 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hcn2O88703 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hcn2O88703 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hcn2O88703 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hcn2O88703 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hcn2O88703 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hcn2O88703 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hcn2O88703 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hcn2O88703 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hcn2O88703 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hcn2O88703 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hcn2O88703 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hcn2O88703 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hcn2O88703 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Hcn2O88703 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hcn2O88703 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hcn2O88703 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hcn2O88703 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hcn2O88703 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hcn2O88703 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hcn2O88703 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hcn2O88703 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hcn2O88703 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hcn2O88703 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hcn2O88703 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hcn2O88703 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Hcn2O88703 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hcn2O88703 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hcn2O88703 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hcn2O88703 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms