Protein–RNA interactions for Protein: O88602

Cacng2, Voltage-dependent calcium channel gamma-2 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng2O88602 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cacng2O88602 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cacng2O88602 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cacng2O88602 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cacng2O88602 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cacng2O88602 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cacng2O88602 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cacng2O88602 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cacng2O88602 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cacng2O88602 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cacng2O88602 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cacng2O88602 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cacng2O88602 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cacng2O88602 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cacng2O88602 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cacng2O88602 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cacng2O88602 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cacng2O88602 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cacng2O88602 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cacng2O88602 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cacng2O88602 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cacng2O88602 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cacng2O88602 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cacng2O88602 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cacng2O88602 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cacng2O88602 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cacng2O88602 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cacng2O88602 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cacng2O88602 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cacng2O88602 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cacng2O88602 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cacng2O88602 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cacng2O88602 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cacng2O88602 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cacng2O88602 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cacng2O88602 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cacng2O88602 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cacng2O88602 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cacng2O88602 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cacng2O88602 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cacng2O88602 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cacng2O88602 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cacng2O88602 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Cacng2O88602 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cacng2O88602 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cacng2O88602 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cacng2O88602 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cacng2O88602 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cacng2O88602 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cacng2O88602 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cacng2O88602 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cacng2O88602 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cacng2O88602 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cacng2O88602 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cacng2O88602 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cacng2O88602 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cacng2O88602 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cacng2O88602 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cacng2O88602 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cacng2O88602 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cacng2O88602 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cacng2O88602 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cacng2O88602 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cacng2O88602 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cacng2O88602 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cacng2O88602 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cacng2O88602 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cacng2O88602 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cacng2O88602 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cacng2O88602 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cacng2O88602 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cacng2O88602 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cacng2O88602 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Cacng2O88602 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Cacng2O88602 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cacng2O88602 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cacng2O88602 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cacng2O88602 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cacng2O88602 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cacng2O88602 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cacng2O88602 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cacng2O88602 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cacng2O88602 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cacng2O88602 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cacng2O88602 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cacng2O88602 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cacng2O88602 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cacng2O88602 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cacng2O88602 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cacng2O88602 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cacng2O88602 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cacng2O88602 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cacng2O88602 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cacng2O88602 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cacng2O88602 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cacng2O88602 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cacng2O88602 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cacng2O88602 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cacng2O88602 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cacng2O88602 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms