Protein–RNA interactions for Protein: O88561

Slc27a3, Long-chain fatty acid transport protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a3O88561 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc27a3O88561 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc27a3O88561 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc27a3O88561 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc27a3O88561 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc27a3O88561 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Slc27a3O88561 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Slc27a3O88561 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Slc27a3O88561 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc27a3O88561 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc27a3O88561 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc27a3O88561 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc27a3O88561 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc27a3O88561 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc27a3O88561 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc27a3O88561 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc27a3O88561 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc27a3O88561 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc27a3O88561 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc27a3O88561 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc27a3O88561 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc27a3O88561 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc27a3O88561 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc27a3O88561 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc27a3O88561 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc27a3O88561 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc27a3O88561 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc27a3O88561 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc27a3O88561 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc27a3O88561 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc27a3O88561 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc27a3O88561 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc27a3O88561 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc27a3O88561 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc27a3O88561 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc27a3O88561 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc27a3O88561 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc27a3O88561 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc27a3O88561 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc27a3O88561 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc27a3O88561 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc27a3O88561 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc27a3O88561 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc27a3O88561 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc27a3O88561 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc27a3O88561 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc27a3O88561 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc27a3O88561 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc27a3O88561 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc27a3O88561 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc27a3O88561 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc27a3O88561 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc27a3O88561 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc27a3O88561 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc27a3O88561 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc27a3O88561 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc27a3O88561 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc27a3O88561 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc27a3O88561 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc27a3O88561 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc27a3O88561 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc27a3O88561 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc27a3O88561 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc27a3O88561 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc27a3O88561 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc27a3O88561 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc27a3O88561 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc27a3O88561 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc27a3O88561 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc27a3O88561 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc27a3O88561 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc27a3O88561 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Slc27a3O88561 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc27a3O88561 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc27a3O88561 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Slc27a3O88561 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Slc27a3O88561 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Slc27a3O88561 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc27a3O88561 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc27a3O88561 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc27a3O88561 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc27a3O88561 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc27a3O88561 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc27a3O88561 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc27a3O88561 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc27a3O88561 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc27a3O88561 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc27a3O88561 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc27a3O88561 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc27a3O88561 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc27a3O88561 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc27a3O88561 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc27a3O88561 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc27a3O88561 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc27a3O88561 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc27a3O88561 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc27a3O88561 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc27a3O88561 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc27a3O88561 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc27a3O88561 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms